- PDB-3c3h: alpha/beta-Peptide helix bundles: A GCN4-pLI analogue with an (al... -
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基本情報
登録情報
データベース: PDB / ID: 3c3h
タイトル
alpha/beta-Peptide helix bundles: A GCN4-pLI analogue with an (alpha-alpha-beta) backbone and cyclic beta residues
要素
alpha/beta-peptide based on the GCN4-pLI side chain sequence, with an (alpha-alpha-beta) backbone and cyclic beta-residues at positions 1, 4, 10, 19, 22, and 28
キーワード
DE NOVO PROTEIN / helix bundle / foldamer / alpha/beta-peptide / UNKNOWN FUNCTION
A: alpha/beta-peptide based on the GCN4-pLI side chain sequence, with an (alpha-alpha-beta) backbone and cyclic beta-residues at positions 1, 4, 10, 19, 22, and 28
A: alpha/beta-peptide based on the GCN4-pLI side chain sequence, with an (alpha-alpha-beta) backbone and cyclic beta-residues at positions 1, 4, 10, 19, 22, and 28
A: alpha/beta-peptide based on the GCN4-pLI side chain sequence, with an (alpha-alpha-beta) backbone and cyclic beta-residues at positions 1, 4, 10, 19, 22, and 28
A: alpha/beta-peptide based on the GCN4-pLI side chain sequence, with an (alpha-alpha-beta) backbone and cyclic beta-residues at positions 1, 4, 10, 19, 22, and 28
A: alpha/beta-peptide based on the GCN4-pLI side chain sequence, with an (alpha-alpha-beta) backbone and cyclic beta-residues at positions 1, 4, 10, 19, 22, and 28
モノクロメーター: gobel mirrors / プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray
放射波長
波長: 1.5418 Å / 相対比: 1
反射
解像度: 2.2→35.5 Å / Num. all: 1711 / Num. obs: 1690 / % possible obs: 98.8 % / 冗長度: 5.6 % / Rsym value: 0.098 / Net I/σ(I): 12.6
反射 シェル
解像度: 2.2→2.3 Å / 冗長度: 3.7 % / Mean I/σ(I) obs: 3.7 / Rsym value: 0.309 / % possible all: 92.7
-
解析
ソフトウェア
名称
バージョン
分類
REFMAC
5.4.0062
精密化
PROTEUM PLUS
PLUS
データ収集
PROTEUM PLUS
PLUS
データ削減
PROTEUM PLUS
PLUS
データスケーリング
PHASER
位相決定
精密化
構造決定の手法: 分子置換 / 解像度: 2.2→22.01 Å / Cor.coef. Fo:Fc: 0.923 / Cor.coef. Fo:Fc free: 0.842 / SU B: 8.658 / SU ML: 0.208 / 交差検証法: THROUGHOUT / ESU R: 0.389 / ESU R Free: 0.259 / 立体化学のターゲット値: MAXIMUM LIKELIHOOD / 詳細: HYDROGENS HAVE BEEN ADDED IN THE RIDING POSITIONS
Rfactor
反射数
%反射
Selection details
Rfree
0.27771
73
4.3 %
RANDOM
Rwork
0.23251
-
-
-
obs
0.23468
1606
98.88 %
-
溶媒の処理
イオンプローブ半径: 0.8 Å / 減衰半径: 0.8 Å / VDWプローブ半径: 1.4 Å / 溶媒モデル: MASK