+データを開く
-基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 3bjl | ||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
タイトル | LOC, A LAMBDA 1 TYPE LIGHT-CHAIN DIMER (BENCE-JONES PROTEIN) CRYSTALLIZED IN AMMONIUM SULFATE | ||||||||||||
要素 | LOC - LAMBDA 1 TYPE LIGHT-CHAIN DIMER | ||||||||||||
キーワード | IMMUNOGLOBULIN / BENCE JONES / ANTIBODY / MULTIPLE QUATERNARY STRUCTURES | ||||||||||||
機能・相同性 | Immunoglobulins / Immunoglobulin-like / Sandwich / Mainly Beta / : 機能・相同性情報 | ||||||||||||
生物種 | Homo sapiens (ヒト) | ||||||||||||
手法 | X線回折 / 解像度: 2.3 Å | ||||||||||||
データ登録者 | Schiffer, M. / Huang, D.B. | ||||||||||||
引用 | ジャーナル: Proc.Natl.Acad.Sci.USA / 年: 1996 タイトル: Three quaternary structures for a single protein. 著者: Huang, D.B. / Ainsworth, C.F. / Stevens, F.J. / Schiffer, M. #1: ジャーナル: Biochemistry / 年: 1985 タイトル: Novel Arrangement of Immunoglobulin Variable Domains: X-Ray Crystallographic Analysis of the Lambda-Chain Dimer Bence-Jones Protein Loc 著者: Chang, C.-H. / Short, M.T. / Westholm, F.A. / Stevens, F.J. / Wang, B.-C. / Furey Junior, W. / Solomon, A. / Schiffer, M. | ||||||||||||
履歴 |
|
-構造の表示
構造ビューア | 分子: MolmilJmol/JSmol |
---|
-ダウンロードとリンク
-ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | 3bjl.cif.gz | 96.2 KB | 表示 | PDBx/mmCIF形式 |
---|---|---|---|---|
PDB形式 | pdb3bjl.ent.gz | 78.2 KB | 表示 | PDB形式 |
PDBx/mmJSON形式 | 3bjl.json.gz | ツリー表示 | PDBx/mmJSON形式 | |
その他 | その他のダウンロード |
-検証レポート
文書・要旨 | 3bjl_validation.pdf.gz | 433.6 KB | 表示 | wwPDB検証レポート |
---|---|---|---|---|
文書・詳細版 | 3bjl_full_validation.pdf.gz | 479.9 KB | 表示 | |
XML形式データ | 3bjl_validation.xml.gz | 28.8 KB | 表示 | |
CIF形式データ | 3bjl_validation.cif.gz | 40.2 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/bj/3bjl ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/bj/3bjl | HTTPS FTP |
-関連構造データ
-リンク
-集合体
登録構造単位 |
| ||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
1 |
| ||||||||
単位格子 |
| ||||||||
Atom site foot note | 1: CIS PROLINE - PRO A 145 / 2: CIS PROLINE - PRO B 145 |
-要素
#1: 抗体 | 分子量: 22769.982 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 天然 / 詳細: CRYSTALLIZED IN AMMONIUM SULFATE / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: PIR: S25754 #2: 水 | ChemComp-HOH / | |
---|
-実験情報
-実験
実験 | 手法: X線回折 |
---|
-試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.76 Å3/Da / 溶媒含有率: 55.4 % |
---|---|
結晶化 | *PLUS 手法: unknown |
溶液の組成 | *PLUS 濃度: 1.8 M / 一般名: ammonium sulfate |
-データ収集
反射 | 解像度: 2.3→13 Å / Num. obs: 18991 |
---|---|
反射 | *PLUS Rmerge(I) obs: 0.037 |
-解析
ソフトウェア |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
精密化 | 解像度: 2.3→10 Å / σ(F): 3 /
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 2.3→10 Å
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
拘束条件 |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ソフトウェア | *PLUS 名称: PROLSQ / 分類: refinement | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
精密化 | *PLUS 最高解像度: 2.4 Å | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
溶媒の処理 | *PLUS | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
原子変位パラメータ | *PLUS |