登録情報 | データベース: PDB / ID: 3aj3 |
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タイトル | Crystal structure of selenomethionine substituted 4-pyridoxolactonase from Mesorhizobium loti |
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要素 | 4-pyridoxolactonase |
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キーワード | HYDROLASE / Zn-protein / metallo-beta-lactamase |
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機能・相同性 | 機能・相同性情報
4-pyridoxolactonase / 4-pyridoxolactonase activity / vitamin B6 catabolic process / metal ion binding類似検索 - 分子機能 : / Metallo-beta-lactamase superfamily / Ribonuclease Z/Hydroxyacylglutathione hydrolase-like / Metallo-beta-lactamase; Chain A / Metallo-beta-lactamase superfamily / Metallo-beta-lactamase / Ribonuclease Z/Hydroxyacylglutathione hydrolase-like / 4-Layer Sandwich / Alpha Beta類似検索 - ドメイン・相同性 |
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生物種 | Mesorhizobium loti (根粒菌) |
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手法 | X線回折 / シンクロトロン / 単波長異常分散 / 解像度: 1.577 Å |
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データ登録者 | Kobayashi, J. / Yoshikane, Y. / Baba, S. / Mikami, B. / Yagi, T. |
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引用 | ジャーナル: Acta Crystallogr.,Sect.F / 年: 2014 タイトル: Structure of 4-pyridoxolactonase from Mesorhizobium loti. 著者: Kobayashi, J. / Yoshikane, Y. / Yagi, T. / Baba, S. / Mizutani, K. / Takahashi, N. / Mikami, B. |
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履歴 | 登録 | 2010年5月21日 | 登録サイト: PDBJ / 処理サイト: PDBJ |
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改定 1.0 | 2011年5月25日 | Provider: repository / タイプ: Initial release |
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改定 1.1 | 2011年7月13日 | Group: Version format compliance |
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改定 1.2 | 2014年4月9日 | Group: Database references |
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改定 1.3 | 2020年1月1日 | Group: Database references / Derived calculations / カテゴリ: citation / struct_conn / struct_ref_seq_dif Item: _citation.country / _citation.journal_id_ASTM ..._citation.country / _citation.journal_id_ASTM / _citation.journal_id_ISSN / _citation.pdbx_database_id_PubMed / _citation.title / _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag / _struct_ref_seq_dif.details |
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改定 1.4 | 2024年3月20日 | Group: Data collection / Database references ...Data collection / Database references / Derived calculations / Refinement description カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_struct_conn_angle / refine / struct_conn / struct_site Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ..._database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_atom_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_atom_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.value / _refine.pdbx_starting_model / _struct_conn.pdbx_dist_value / _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr1_label_asym_id / _struct_conn.ptnr1_label_atom_id / _struct_conn.ptnr1_label_comp_id / _struct_conn.ptnr1_label_seq_id / _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr2_label_asym_id / _struct_conn.ptnr2_label_atom_id / _struct_conn.ptnr2_label_comp_id / _struct_site.pdbx_auth_asym_id / _struct_site.pdbx_auth_comp_id / _struct_site.pdbx_auth_seq_id |
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