ソフトウェア | 名称 | バージョン | 分類 |
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HKL-2000 | | データ収集 | MOLREP | | 位相決定 | REFMAC | 5.5.0102精密化 | HKL-2000 | | データ削減 | HKL-2000 | | データスケーリング | |
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精密化 | 構造決定の手法: 分子置換 / 解像度: 1.9→42.65 Å / Cor.coef. Fo:Fc: 0.948 / Cor.coef. Fo:Fc free: 0.94 / SU B: 4.253 / SU ML: 0.121 / 交差検証法: THROUGHOUT / ESU R: 0.221 / ESU R Free: 0.169 立体化学のターゲット値: MAXIMUM LIKELIHOOD WITH PHASES 詳細: HYDROGENS HAVE BEEN ADDED IN THE RIDING POSITIONS
| Rfactor | 反射数 | %反射 | Selection details |
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Rfree | 0.23058 | 482 | 4.7 % | RANDOM |
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Rwork | 0.20078 | - | - | - |
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obs | 0.20225 | 9678 | 95.61 % | - |
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溶媒の処理 | イオンプローブ半径: 0.8 Å / 減衰半径: 0.8 Å / VDWプローブ半径: 1.4 Å / 溶媒モデル: MASK |
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原子変位パラメータ | Biso mean: 27.978 Å2
| Baniso -1 | Baniso -2 | Baniso -3 |
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1- | 0.21 Å2 | 0 Å2 | 0 Å2 |
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2- | - | -0.01 Å2 | 0 Å2 |
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3- | - | - | -0.2 Å2 |
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精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 1.9→42.65 Å
| タンパク質 | 核酸 | リガンド | 溶媒 | 全体 |
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原子数 | 1213 | 0 | 0 | 139 | 1352 |
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拘束条件 | Refine-ID | タイプ | Dev ideal | Dev ideal target | 数 |
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X-RAY DIFFRACTION | r_bond_refined_d0.008 | 0.021 | 1241 | X-RAY DIFFRACTION | r_angle_refined_deg0.944 | 1.925 | 1681 | X-RAY DIFFRACTION | r_dihedral_angle_1_deg6.132 | 5 | 152 | X-RAY DIFFRACTION | r_dihedral_angle_2_deg40.35 | 24.098 | 61 | X-RAY DIFFRACTION | r_dihedral_angle_3_deg15.11 | 15 | 211 | X-RAY DIFFRACTION | r_dihedral_angle_4_deg23.479 | 15 | 9 | X-RAY DIFFRACTION | r_chiral_restr0.076 | 0.2 | 176 | X-RAY DIFFRACTION | r_gen_planes_refined0.017 | 0.021 | 957 | X-RAY DIFFRACTION | r_mcbond_it1.962 | 1.5 | 756 | X-RAY DIFFRACTION | r_mcangle_it3.041 | 2 | 1206 | X-RAY DIFFRACTION | r_scbond_it4.719 | 3 | 485 | X-RAY DIFFRACTION | r_scangle_it7.368 | 4.5 | 475 | | | | | | | | | | | | |
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LS精密化 シェル | 解像度: 1.899→1.948 Å / Total num. of bins used: 20
| Rfactor | 反射数 | %反射 |
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Rfree | 0.301 | 21 | - |
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Rwork | 0.295 | 567 | - |
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obs | - | - | 79.35 % |
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