登録情報 | データベース: PDB / ID: 3a27 |
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タイトル | Crystal structure of M. jannaschii TYW2 in complex with AdoMet |
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要素 | Uncharacterized protein MJ1557 |
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キーワード | TRANSFERASE / Wybutosine modification |
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機能・相同性 | 機能・相同性情報
tRNAPhe (4-demethylwyosine37-C7) aminocarboxypropyltransferase / tRNA 4-demethylwyosine alpha-amino-alpha-carboxypropyltransferase activity / tRNA methyltransferase activity / transferase activity, transferring alkyl or aryl (other than methyl) groups / tRNA modification / tRNA methylation / cytoplasm類似検索 - 分子機能 tRNA(Phe) (4-demethylwyosine(37)-C(7)) aminocarboxypropyltransferase / SAM-dependent methyltransferase TRM5/TYW2-type domain profile. / SAM-dependent methyltransferase TRM5/TYW2-type / Met-10+ like-protein / Vaccinia Virus protein VP39 / S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase superfamily / Rossmann fold / 3-Layer(aba) Sandwich / Alpha Beta類似検索 - ドメイン・相同性 S-ADENOSYLMETHIONINE / tRNA(Phe) (4-demethylwyosine(37)-C(7)) aminocarboxypropyltransferase類似検索 - 構成要素 |
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生物種 | ![](img/tx_archaea.gif) Methanocaldococcus jannaschii (メタン生成菌) |
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手法 | X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度: 2.005 Å |
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データ登録者 | Umitsu, M. / Nishimasu, H. / Ishitani, R. / Nureki, O. |
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引用 | ジャーナル: Proc.Natl.Acad.Sci.USA / 年: 2009 タイトル: Structural basis of AdoMet-dependent aminocarboxypropyl transfer reaction catalyzed by tRNA-wybutosine synthesizing enzyme, TYW2 著者: Umitsu, M. / Nishimasu, H. / Noma, A. / Suzuki, T. / Ishitani, R. / Nureki, O. |
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履歴 | 登録 | 2009年4月28日 | 登録サイト: PDBJ / 処理サイト: PDBJ |
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改定 1.0 | 2009年9月15日 | Provider: repository / タイプ: Initial release |
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改定 1.1 | 2011年7月13日 | Group: Version format compliance |
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改定 1.2 | 2023年11月1日 | Group: Data collection / Database references ...Data collection / Database references / Derived calculations / Refinement description カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model / struct_ref_seq_dif / struct_site Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ..._database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _struct_ref_seq_dif.details / _struct_site.pdbx_auth_asym_id / _struct_site.pdbx_auth_comp_id / _struct_site.pdbx_auth_seq_id |
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