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Yorodumi- PDB-2zbk: Crystal structure of an intact type II DNA topoisomerase: insight... -
+Open data
-Basic information
Entry | Database: PDB / ID: 2zbk | ||||||
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Title | Crystal structure of an intact type II DNA topoisomerase: insights into DNA transfer mechanisms | ||||||
Components |
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Keywords | ISOMERASE / DNA topoisomerase / DNA binding protein / decatenation / ATPase / drug design / DNA-binding / Magnesium / Metal-binding / ATP-binding / Nucleotide-binding / Structural Genomics / Paris-Sud Yeast Structural Genomics / YSG | ||||||
Function / homology | Function and homology information DNA endonuclease activity, producing 3'-phosphomonoesters / : / DNA topoisomerase type II (double strand cut, ATP-hydrolyzing) complex / DNA topoisomerase type II (double strand cut, ATP-hydrolyzing) activity / DNA topoisomerase (ATP-hydrolysing) / DNA unwinding involved in DNA replication / DNA topological change / chromosome / magnesium ion binding / DNA binding ...DNA endonuclease activity, producing 3'-phosphomonoesters / : / DNA topoisomerase type II (double strand cut, ATP-hydrolyzing) complex / DNA topoisomerase type II (double strand cut, ATP-hydrolyzing) activity / DNA topoisomerase (ATP-hydrolysing) / DNA unwinding involved in DNA replication / DNA topological change / chromosome / magnesium ion binding / DNA binding / ATP binding / identical protein binding Similarity search - Function | ||||||
Biological species | Sulfolobus shibatae (archaea) | ||||||
Method | X-RAY DIFFRACTION / SYNCHROTRON / SAD / Resolution: 3.56 Å | ||||||
Authors | Graille, M. / Cladiere, L. / Durand, D. / Lecointe, F. / Forterre, P. / van Tilbeurgh, H. / Paris-Sud Yeast Structural Genomics (YSG) | ||||||
Citation | Journal: Structure / Year: 2008 Title: Crystal Structure of an Intact Type II DNA Topoisomerase: Insights into DNA Transfer Mechanisms Authors: Graille, M. / Durand, D. / Lecointe, F. / Gadelle, D. / Quevillon-Cheruel, S. / Vachette, P. / Forterre, P. / van Tilbeurgh, H. | ||||||
History |
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-Structure visualization
Structure viewer | Molecule: MolmilJmol/JSmol |
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-Downloads & links
-Download
PDBx/mmCIF format | 2zbk.cif.gz | 674.9 KB | Display | PDBx/mmCIF format |
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PDB format | pdb2zbk.ent.gz | 546.4 KB | Display | PDB format |
PDBx/mmJSON format | 2zbk.json.gz | Tree view | PDBx/mmJSON format | |
Others | Other downloads |
-Validation report
Arichive directory | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/zb/2zbk ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/zb/2zbk | HTTPS FTP |
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-Related structure data
-Links
-Assembly
Deposited unit |
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Unit cell |
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Noncrystallographic symmetry (NCS) | NCS domain:
NCS domain segments: Component-ID: 1 / Refine code: 1
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