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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 2yug | ||||||
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タイトル | Solution structure of mouse FRG1 protein | ||||||
![]() | Protein FRG1 | ||||||
![]() | GENE REGULATION / spliceosome / facioscapulohumeral muscular dystrophy / FSHD1 / beta-trefoil / Structural Genomics / NPPSFA / National Project on Protein Structural and Functional Analyses / RIKEN Structural Genomics/Proteomics Initiative / RSGI | ||||||
機能・相同性 | ![]() striated muscle dense body / muscle organ development / Cajal body / catalytic step 2 spliceosome / RNA splicing / mRNA processing / Z disc / rRNA processing / actin filament binding / nucleolus / RNA binding 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | ![]() ![]() | ||||||
手法 | 溶液NMR | ||||||
![]() | Saito, K. / Kigawa, T. / Yokoyama, S. / RIKEN Structural Genomics/Proteomics Initiative (RSGI) | ||||||
![]() | ![]() タイトル: Solution structure of mouse FRG1 protein 著者: Saito, K. / Kigawa, T. / Yokoyama, S. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 887.3 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 745.3 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 342.2 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 471.5 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 58.4 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 72.4 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
類似構造データ | |
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その他のデータベース |
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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NMR アンサンブル |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 16627.549 Da / 分子数: 1 / 断片: frg1 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) ![]() ![]() |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: 溶液NMR | ||||||||||||
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NMR実験 |
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試料調製
詳細 | 内容: 1mM protein, 20mM d-Tris-HCl, 100mM NaCl, 1mM d-DTT, 0.02% NaN3; 90% H2O, 10% D2O 溶媒系: 90% H2O/10% D2O |
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試料状態 | イオン強度: 120 / pH: 7.0 / 圧: ambient / 温度: 298 K |
-NMR測定
NMRスペクトロメーター | タイプ: Bruker AVANCE / 製造業者: Bruker / モデル: AVANCE / 磁場強度: 800 MHz |
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解析
NMR software |
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代表構造 | 選択基準: lowest energy | ||||||||||||||||||||||||
NMRアンサンブル | コンフォーマー選択の基準: structures with the lowest energy 計算したコンフォーマーの数: 100 / 登録したコンフォーマーの数: 20 |