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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 2xeh | ||||||
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タイトル | Structural Determinants for Improved Thermal Stability of Designed Ankyrin Repeat Proteins With a Redesigned C-capping Module. | ||||||
![]() | NI3C MUT6 | ||||||
![]() | DE NOVO PROTEIN / PROTEIN ENGINEERING / PROTEIN-PROTEIN INTERACTION | ||||||
機能・相同性 | Ankyrin repeat-containing domain / Serine Threonine Protein Phosphatase 5, Tetratricopeptide repeat / Alpha Horseshoe / Mainly Alpha![]() | ||||||
生物種 | SYNTHETIC CONSTRUCT (人工物) | ||||||
手法 | ![]() ![]() | ||||||
![]() | Kramer, M. / Wetzel, S.K. / Pluckthun, A. / Mittl, P. / Grutter, M. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: Structural Determinants for Improved Thermal Stability of Designed Ankyrin Repeat Proteins with a Redesigned C-Capping Module. 著者: Kramer, M. / Wetzel, S.K. / Pluckthun, A. / Mittl, P. / Grutter, M. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 102.4 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 81.6 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 444.7 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 450 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 21.3 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 30.2 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 | ![]()
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3 | ![]()
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単位格子 |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 16869.068 Da / 分子数: 3 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) SYNTHETIC CONSTRUCT (人工物) / 発現宿主: ![]() ![]() #2: 化合物 | ChemComp-SO4 / #3: 水 | ChemComp-HOH / | |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.4 Å3/Da / 溶媒含有率: 48.81 % / 解説: NONE |
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-データ収集
回折 | 平均測定温度: 100 K |
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放射光源 | 由来: ![]() ![]() ![]() |
検出器 | タイプ: DECTRIS PILATUS 6M / 検出器: PIXEL |
放射 | プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray |
放射波長 | 波長: 1 Å / 相対比: 1 |
反射 | 解像度: 1.8→50 Å / Num. obs: 44196 / % possible obs: 99.4 % / Observed criterion σ(I): 0 / 冗長度: 6.3 % / Biso Wilson estimate: 25.33 Å2 / Rmerge(I) obs: 0.07 |
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解析
ソフトウェア | 名称: PHENIX / バージョン: (PHENIX.REFINE) / 分類: 精密化 | ||||||||||||||||||||||||||||
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精密化 | 構造決定の手法: OTHER 開始モデル: NONE 解像度: 1.81→42.194 Å / SU ML: 0.07 / σ(F): 2 / 位相誤差: 27.77 / 立体化学のターゲット値: ML
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溶媒の処理 | 減衰半径: 0.9 Å / VDWプローブ半径: 1.11 Å / 溶媒モデル: FLAT BULK SOLVENT MODEL / Bsol: 49.645 Å2 / ksol: 0.403 e/Å3 | ||||||||||||||||||||||||||||
原子変位パラメータ |
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精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 1.81→42.194 Å
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拘束条件 |
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LS精密化 シェル |
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