[English] 日本語
Yorodumi- PDB-2wfm: Crystal structure of polyneuridine aldehyde esterase mutant (H244A) -
+
Open data
-
Basic information
| Entry | Database: PDB / ID: 2wfm | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Title | Crystal structure of polyneuridine aldehyde esterase mutant (H244A) | ||||||
Components | POLYNEURIDINE ALDEHYDE ESTERASE | ||||||
Keywords | HYDROLASE / ALKALOID METABOLISM / MONOTERPENOID INDOLE ALKALOIDS / PNAE / SERINE ESTERASE | ||||||
| Function / homology | Function and homology informationpolyneuridine-aldehyde esterase / polyneuridine-aldehyde esterase activity / indole alkaloid metabolic process / jasmonic acid metabolic process / methyl salicylate esterase activity / methyl indole-3-acetate esterase activity / methyl jasmonate esterase activity / salicylic acid metabolic process Similarity search - Function | ||||||
| Biological species | RAUVOLFIA SERPENTINA (serpentwood) | ||||||
| Method | X-RAY DIFFRACTION / SYNCHROTRON / MOLECULAR REPLACEMENT / Resolution: 2.2 Å | ||||||
Authors | Yang, L. / Hill, M. / Panjikar, S. / Wang, M. / Stoeckigt, J. | ||||||
Citation | Journal: Angew.Chem.Int.Ed.Engl. / Year: 2009Title: Structural Basis and Enzymatic Mechanism of the Biosynthesis of C9- from C10-Monoterpenoid Indole Alkaloids. Authors: Yang, L. / Hill, M. / Wang, M. / Panjikar, S. / Stockigt, J. | ||||||
| History |
|
-
Structure visualization
| Structure viewer | Molecule: Molmil Jmol/JSmol |
|---|
-
Downloads & links
-
Download
| PDBx/mmCIF format | 2wfm.cif.gz | 256.2 KB | Display | PDBx/mmCIF format |
|---|---|---|---|---|
| PDB format | pdb2wfm.ent.gz | 210.8 KB | Display | PDB format |
| PDBx/mmJSON format | 2wfm.json.gz | Tree view | PDBx/mmJSON format | |
| Others | Other downloads |
-Validation report
| Arichive directory | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/wf/2wfm ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/wf/2wfm | HTTPS FTP |
|---|
-Related structure data
| Related structure data | ![]() 2wflSC ![]() 3gzjC S: Starting model for refinement C: citing same article ( |
|---|---|
| Similar structure data |
-
Links
-
Assembly
| Deposited unit | ![]()
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | ![]()
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 2 | ![]()
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 3 | ![]()
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 4 | ![]()
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 5 | ![]()
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Unit cell |
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Noncrystallographic symmetry (NCS) | NCS domain:
NCS domain segments: Ens-ID: 1 / Refine code: 2
|
Movie
Controller
Components
About Yorodumi



RAUVOLFIA SERPENTINA (serpentwood)
X-RAY DIFFRACTION
Citation











PDBj







