登録情報 | データベース: PDB / ID: 2w04 |
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タイトル | Co-complex Structure of Achromobactin Synthetase Protein D (AcsD) with citrate in ATP binding site from Pectobacterium Chrysanthemi |
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要素 | ACSD |
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キーワード | METAL TRANSPORT / ACSD / PECTOBACTERIUM CHRYSANTHEMI / ACHROMOBACTIN BIOSYNTHESIS / SSPF |
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機能・相同性 | 機能・相同性情報
acid-amino acid ligase activity / siderophore biosynthetic process / ATP binding / metal ion binding類似検索 - 分子機能 AcsD, thumb domain, helical bundle / AcsD, palm domain, helix bundle / N-terminal domain of TfIIb - #450 / AscD, thumb domain, four stranded beta-sheet / Double Stranded RNA Binding Domain - #870 / PvsD/AcsD-like, thumb domain, helical bundle / PvsD/AcsD-like, thumb domain, four stranded beta-sheet / PvsD/AcsD-like, palm domain, helix bundle / Aerobactin siderophore biosynthesis, IucA/IucC, N-terminal / Aerobactin siderophore biosynthesis, IucA/IucC-like ...AcsD, thumb domain, helical bundle / AcsD, palm domain, helix bundle / N-terminal domain of TfIIb - #450 / AscD, thumb domain, four stranded beta-sheet / Double Stranded RNA Binding Domain - #870 / PvsD/AcsD-like, thumb domain, helical bundle / PvsD/AcsD-like, thumb domain, four stranded beta-sheet / PvsD/AcsD-like, palm domain, helix bundle / Aerobactin siderophore biosynthesis, IucA/IucC, N-terminal / Aerobactin siderophore biosynthesis, IucA/IucC-like / IucA / IucC family / Ferric iron reductase FhuF domain / Ferric iron reductase FhuF-like transporter / Endonuclease III; domain 1 / N-terminal domain of TfIIb / Double Stranded RNA Binding Domain / Single Sheet / SH3 type barrels. / DNA polymerase; domain 1 / Roll / 2-Layer Sandwich / Orthogonal Bundle / Mainly Beta / Mainly Alpha / Alpha Beta類似検索 - ドメイン・相同性 |
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生物種 | ERWINIA CHRYSANTHEMI (バクテリア) |
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手法 | X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度: 2.8 Å |
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データ登録者 | Schmelz, S. / McMahon, S.A. / Kadi, N. / Song, L. / Oves-Costales, D. / Oke, M. / Liu, H. / Johnson, K.A. / Carter, L. / White, M.F. ...Schmelz, S. / McMahon, S.A. / Kadi, N. / Song, L. / Oves-Costales, D. / Oke, M. / Liu, H. / Johnson, K.A. / Carter, L. / White, M.F. / Challis, G.L. / Naismith, J.H. |
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引用 | ジャーナル: Nat.Chem.Biol. / 年: 2009 タイトル: Acsd Catalyzes Enantioselective Citrate Desymmetrization in Siderophore Biosynthesis 著者: Schmelz, S. / Kadi, N. / Mcmahon, S.A. / Song, L. / Oves-Costales, D. / Oke, M. / Liu, H. / Johnson, K.A. / Carter, L. / Botting, C.H. / White, M.F. / Challis, G.L. / Naismith, J.H. |
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履歴 | 登録 | 2008年8月8日 | 登録サイト: PDBE / 処理サイト: PDBE |
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改定 1.0 | 2009年1月13日 | Provider: repository / タイプ: Initial release |
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改定 1.1 | 2011年5月7日 | Group: Version format compliance |
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改定 1.2 | 2011年7月13日 | Group: Version format compliance |
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改定 1.3 | 2019年5月29日 | Group: Data collection / Experimental preparation / Other カテゴリ: exptl_crystal_grow / pdbx_database_proc ...exptl_crystal_grow / pdbx_database_proc / pdbx_database_status / struct_biol Item: _exptl_crystal_grow.method / _pdbx_database_status.recvd_author_approval |
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改定 1.4 | 2024年5月1日 | Group: Data collection / Database references ...Data collection / Database references / Other / Refinement description カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_database_status / pdbx_initial_refinement_model / struct_ncs_dom_lim Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ..._database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _pdbx_database_status.status_code_sf / _struct_ncs_dom_lim.beg_auth_comp_id / _struct_ncs_dom_lim.beg_label_asym_id / _struct_ncs_dom_lim.beg_label_comp_id / _struct_ncs_dom_lim.beg_label_seq_id / _struct_ncs_dom_lim.end_auth_comp_id / _struct_ncs_dom_lim.end_label_asym_id / _struct_ncs_dom_lim.end_label_comp_id / _struct_ncs_dom_lim.end_label_seq_id |
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