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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 2uuz | ||||||
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タイトル | Orthorhombic crystal form of GamS from bacteriophage lambda. | ||||||
![]() | HOST-NUCLEASE INHIBITOR PROTEIN GAM | ||||||
![]() | INHIBITOR / BACTERIOPHAGE LAMBDA / NUCLEASE INHIBITOR / RECBCD INHIBITOR / PUTATIVE DNA MIMIC | ||||||
機能・相同性 | ![]() symbiont-mediated evasion of DNA end degradation by host / deoxyribonuclease inhibitor activity / virus-mediated perturbation of host defense response 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | ![]() | ||||||
手法 | ![]() ![]() | ||||||
![]() | Court, R.I. / Cook, N. / Saikrishnan, K. / Wigley, D.B. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: The Crystal Structure of Lambda-Gam Protein Suggests a Model for Recbcd Inhibition. 著者: Court, R.I. / Cook, N. / Saikrishnan, K. / Wigley, D.B. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 48.5 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 35.2 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 257.9 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 263.9 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 8.5 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 11.8 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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単位格子 |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 11733.002 Da / 分子数: 2 / 断片: RESIDUES 40-138 / 由来タイプ: 組換発現 由来: (組換発現) ![]() プラスミド: PKM574 / 発現宿主: ![]() ![]() #2: 水 | ChemComp-HOH / | 配列の詳細 | CONSTRUCT STARTS AT RESIDUE 40 OF REPORTED SEQUENCE. | |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.86 Å3/Da / 溶媒含有率: 48.5 % |
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結晶化 | pH: 8.5 詳細: 100 MM TRIS/HCL, PH 8.5 32-34 % PEG 4000 700-850 MM LICL |
-データ収集
回折 | 平均測定温度: 100 K |
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放射光源 | 由来: ![]() |
検出器 | タイプ: MARRESEARCH / 検出器: IMAGE PLATE / 詳細: MIRRORS |
放射 | プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray |
放射波長 | 波長: 1.542 Å / 相対比: 1 |
反射 | 解像度: 2.3→32 Å / Num. obs: 19530 / % possible obs: 94.6 % / Observed criterion σ(I): 2 / 冗長度: 4.7 % / Rmerge(I) obs: 0.06 / Net I/σ(I): 7.3 |
反射 シェル | 解像度: 2.3→2.42 Å / 冗長度: 5 % / Rmerge(I) obs: 0.25 / Mean I/σ(I) obs: 3.1 / % possible all: 94.6 |
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解析
ソフトウェア |
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精密化 | 構造決定の手法: ![]() 詳細: N-TERMINAL RESIDUES 40-48 OF CHAIN A AND 40-51 OF CHAIN B ARE DISORDERED. THE C-TERMINAL RESIDUE (VAL 138) IS DISORDERED IN BOTH CHAINS.
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溶媒の処理 | Bsol: 52.0685 Å2 / ksol: 0.347938 e/Å3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
原子変位パラメータ |
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精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 2.3→32 Å
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拘束条件 |
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