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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 2rpd | ||||||||||||||||||
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タイトル | Mhr1p-bound ssDNA | ||||||||||||||||||
![]() | DNA (5'-D(*![]() DNA / ssDNA / Mhr1 / RecA | 機能・相同性 | DNA | ![]() 手法 | 溶液NMR / simulated annealing | ![]() Masuda, T. / Ito, Y. / Shibata, T. / Mikawa, T. | ![]() ![]() タイトル: A non-canonical DNA structure enables homologous recombination in various genetic systems 著者: Masuda, T. / Ito, Y. / Terada, T. / Shibata, T. / Mikawa, T. 履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 26.4 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 17.2 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 295.8 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 321.9 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 3.4 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 4.4 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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NMR アンサンブル |
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要素
#1: DNA鎖 | 分子量: 1190.830 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 合成 / 詳細: Nucleotide synthesis |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: 溶液NMR |
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NMR実験 | タイプ: 2D 1H-1H NOESY |
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試料調製
詳細 | 内容: 0.5mM DNA, 100% D2O / 溶媒系: 100% D2O |
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試料 | 濃度: 0.5 mM / 構成要素: DNA |
試料状態 | イオン強度: 50 / pH: 7.1 / 圧: ambient / 温度: 298 K |
-NMR測定
NMRスペクトロメーター | タイプ: Bruker DRX / 製造業者: Bruker / モデル: DRX / 磁場強度: 600 MHz |
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解析
NMR software |
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精密化 | 手法: simulated annealing / ソフトェア番号: 1 | |||||||||
代表構造 | 選択基準: lowest energy | |||||||||
NMRアンサンブル | コンフォーマー選択の基準: structures with the lowest energy 計算したコンフォーマーの数: 100 / 登録したコンフォーマーの数: 10 / 代表コンフォーマー: 1 |