登録情報 データベース : PDB / ID : 2rok 構造の表示 ダウンロードとリンクタイトル Solution structure of the cap-binding domain of PARN complexed with the cap analog 要素poly(A)-specific ribonuclease 詳細 キーワード RNA BINDING PROTEIN / RRM / RBD / CAP / Structural Genomics / NPPSFA / National Project on Protein Structural and Functional Analyses / RIKEN Structural Genomics/Proteomics Initiative / RSGI機能・相同性 機能・相同性情報分子機能 ドメイン・相同性 構成要素
priRNA 3'-end processing / siRNA 3'-end processing / KSRP (KHSRP) binds and destabilizes mRNA / Deadenylation of mRNA / cation binding / box H/ACA sno(s)RNA 3'-end processing / poly(A)-specific ribonuclease / poly(A)-specific ribonuclease activity / miRNA catabolic process / poly(A)-dependent snoRNA 3'-end processing ... priRNA 3'-end processing / siRNA 3'-end processing / KSRP (KHSRP) binds and destabilizes mRNA / Deadenylation of mRNA / cation binding / box H/ACA sno(s)RNA 3'-end processing / poly(A)-specific ribonuclease / poly(A)-specific ribonuclease activity / miRNA catabolic process / poly(A)-dependent snoRNA 3'-end processing / nuclear-transcribed mRNA poly(A) tail shortening / nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay / 3'-5'-RNA exonuclease activity / postsynapse / glutamatergic synapse / nucleolus / RNA binding / nucleus / metal ion binding / cytoplasm 類似検索 - 分子機能 : / Poly(A)-specific ribonuclease, RNA-binding / PARN, R3H domain / RNA binding domain / Ribonuclease CAF1 / R3H domain / CAF1 family ribonuclease / R3H domain / R3H domain superfamily / R3H domain profile. ... : / Poly(A)-specific ribonuclease, RNA-binding / PARN, R3H domain / RNA binding domain / Ribonuclease CAF1 / R3H domain / CAF1 family ribonuclease / R3H domain / R3H domain superfamily / R3H domain profile. / RNA-binding domain superfamily / Ribonuclease H superfamily / Ribonuclease H-like superfamily / Nucleotide-binding alpha-beta plait domain superfamily 類似検索 - ドメイン・相同性 7N-METHYL-8-HYDROGUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE / GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE / Poly(A)-specific ribonuclease PARN / Poly(A)-specific ribonuclease PARN 類似検索 - 構成要素生物種 Mus musculus (ハツカネズミ)手法 溶液NMR / torsion angle dynamics , simulated annealing 詳細データ登録者 Nagata, T. / Suzuki, S. / Endo, R. / Shirouzu, M. / Terada, T. / Inoue, M. / Kigawa, T. / Guntert, P. / Hayashizaki, Y. / Muto, Y. ...Nagata, T. / Suzuki, S. / Endo, R. / Shirouzu, M. / Terada, T. / Inoue, M. / Kigawa, T. / Guntert, P. / Hayashizaki, Y. / Muto, Y. / Yokoyama, S. / RIKEN Structural Genomics/Proteomics Initiative (RSGI) 引用ジャーナル : Nucleic Acids Res. / 年 : 2008タイトル : The RRM domain of poly(A)-specific ribonuclease has a noncanonical binding site for mRNA cap analog recognition.著者 : Nagata, T. / Suzuki, S. / Endo, R. / Shirouzu, M. / Terada, T. / Inoue, M. / Kigawa, T. / Kobayashi, N. / Guntert, P. / Tanaka, A. / Hayashizaki, Y. / Muto, Y. / Yokoyama, S. 履歴 登録 2008年3月28日 登録サイト : BMRB / 処理サイト : PDBJ改定 1.0 2009年2月10日 Provider : repository / タイプ : Initial release改定 1.1 2011年7月13日 Group : Version format compliance改定 1.2 2022年3月16日 Group : Data collection / Database references / Derived calculationsカテゴリ : database_2 / pdbx_nmr_software ... database_2 / pdbx_nmr_software / pdbx_nmr_spectrometer / pdbx_struct_assembly / pdbx_struct_oper_list / struct_conn / struct_ref_seq_dif / struct_site Item : _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ... _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _pdbx_nmr_software.name / _pdbx_nmr_spectrometer.model / _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag / _struct_ref_seq_dif.details / _struct_site.pdbx_auth_asym_id / _struct_site.pdbx_auth_comp_id / _struct_site.pdbx_auth_seq_id 改定 1.3 2024年5月29日 Group : Data collection / カテゴリ : chem_comp_atom / chem_comp_bond
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