登録情報 | データベース: PDB / ID: 2ri8 |
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タイトル | Penicillium citrinum alpha-1,2-mannosidase complex with glycerol |
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要素 | Mannosyl-oligosaccharide alpha-1,2-mannosidase |
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キーワード | HYDROLASE / Alternative conformations / modulation of activity / Glycoprotein / Glycosidase / Secreted |
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機能・相同性 | 機能・相同性情報
mannosyl-oligosaccharide 1,2-alpha-mannosidase / mannosyl-oligosaccharide 1,2-alpha-mannosidase activity / protein glycosylation / carbohydrate metabolic process / calcium ion binding / endoplasmic reticulum / extracellular region / membrane類似検索 - 分子機能 Glycoside hydrolase family 47 / Seven-hairpin glycosidases / Glycosyl hydrolase family 47 / Glycosyltransferase - #10 / Six-hairpin glycosidase-like superfamily / Glycosyltransferase / Alpha/alpha barrel / Mainly Alpha類似検索 - ドメイン・相同性 Mannosyl-oligosaccharide alpha-1,2-mannosidase類似検索 - 構成要素 |
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生物種 | Penicillium citrinum (シトリナム黄変米菌) |
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手法 | X線回折 / 分子置換 / 解像度: 2.16 Å |
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データ登録者 | Lobsanov, Y.D. / Yoshida, T. / Desmet, T. / Nerinckx, W. / Yip, P. / Claeyssens, M. / Herscovics, A. / Howell, P.L. |
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引用 | ジャーナル: Acta Crystallogr.,Sect.D / 年: 2008 タイトル: Modulation of activity by Arg407: structure of a fungal alpha-1,2-mannosidase in complex with a substrate analogue. 著者: Lobsanov, Y.D. / Yoshida, T. / Desmet, T. / Nerinckx, W. / Yip, P. / Claeyssens, M. / Herscovics, A. / Howell, P.L. |
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履歴 | 登録 | 2007年10月10日 | 登録サイト: RCSB / 処理サイト: RCSB |
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改定 1.0 | 2008年3月25日 | Provider: repository / タイプ: Initial release |
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改定 1.1 | 2011年7月13日 | Group: Non-polymer description / Version format compliance |
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改定 1.2 | 2018年1月24日 | Group: Structure summary / カテゴリ: audit_author / Item: _audit_author.name |
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改定 2.0 | 2020年7月29日 | Group: Advisory / Atomic model ...Advisory / Atomic model / Data collection / Derived calculations / Structure summary カテゴリ: atom_site / chem_comp ...atom_site / chem_comp / database_PDB_caveat / entity / pdbx_branch_scheme / pdbx_chem_comp_identifier / pdbx_entity_branch / pdbx_entity_branch_descriptor / pdbx_entity_branch_link / pdbx_entity_branch_list / pdbx_entity_nonpoly / pdbx_nonpoly_scheme / pdbx_struct_assembly_gen / pdbx_struct_conn_angle / pdbx_validate_chiral / struct_asym / struct_conn / struct_site / struct_site_gen Item: _atom_site.B_iso_or_equiv / _atom_site.Cartn_x ..._atom_site.B_iso_or_equiv / _atom_site.Cartn_x / _atom_site.Cartn_y / _atom_site.Cartn_z / _atom_site.auth_asym_id / _atom_site.auth_atom_id / _atom_site.auth_comp_id / _atom_site.auth_seq_id / _atom_site.label_asym_id / _atom_site.label_atom_id / _atom_site.label_comp_id / _atom_site.label_entity_id / _atom_site.occupancy / _atom_site.type_symbol / _chem_comp.name / _chem_comp.type / _entity.formula_weight / _entity.pdbx_description / _entity.pdbx_number_of_molecules / _entity.type / _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_atom_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_atom_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.value / _pdbx_validate_chiral.auth_asym_id / _pdbx_validate_chiral.auth_seq_id / _struct_conn.conn_type_id / _struct_conn.id / _struct_conn.pdbx_dist_value / _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag / _struct_conn.pdbx_role / _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr1_label_asym_id / _struct_conn.ptnr1_label_atom_id / _struct_conn.ptnr1_label_comp_id / _struct_conn.ptnr1_label_seq_id / _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr2_label_asym_id / _struct_conn.ptnr2_label_atom_id / _struct_conn.ptnr2_label_comp_id / _struct_conn.ptnr2_label_seq_id 解説: Carbohydrate remediation / Provider: repository / タイプ: Remediation |
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