登録情報 データベース : PDB / ID : 2qy6 構造の表示 ダウンロードとリンクタイトル Crystal structure of the N-terminal domain of UPF0209 protein yfcK from Escherichia coli O157:H7 要素UPF0209 protein yfcK 詳細 キーワード STRUCTURAL GENOMICS / UNKNOWN FUNCTION / PSI-2 / Protein Structure Initiative / New York SGX Research Center for Structural Genomics / NYSGXRC機能・相同性 機能・相同性情報分子機能 ドメイン・相同性 構成要素
tRNA wobble base modification / 酸化還元酵素; CH-NH結合に対し酸化酵素として働く / tRNA (5-methylaminomethyl-2-thiouridylate)(34)-methyltransferase activity / oxidoreductase activity, acting on the CH-NH group of donors / tRNA 5-(aminomethyl)-2-thiouridylate-methyltransferase / flavin adenine dinucleotide binding / cytoplasm 類似検索 - 分子機能 tRNA U-34 5-methylaminomethyl-2-thiouridine biosynthesis protein MnmC, C-terminal / tRNA 5-methylaminomethyl-2-thiouridine biosynthesis bifunctional protein MnmC / MnmC-like methyltransferase / S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase / FAD dependent oxidoreductase / FAD dependent oxidoreductase / Vaccinia Virus protein VP39 / FAD/NAD(P)-binding domain superfamily / S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase superfamily / Rossmann fold ... tRNA U-34 5-methylaminomethyl-2-thiouridine biosynthesis protein MnmC, C-terminal / tRNA 5-methylaminomethyl-2-thiouridine biosynthesis bifunctional protein MnmC / MnmC-like methyltransferase / S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase / FAD dependent oxidoreductase / FAD dependent oxidoreductase / Vaccinia Virus protein VP39 / FAD/NAD(P)-binding domain superfamily / S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase superfamily / Rossmann fold / 3-Layer(aba) Sandwich / Alpha Beta 類似検索 - ドメイン・相同性 tRNA 5-methylaminomethyl-2-thiouridine biosynthesis bifunctional protein MnmC 類似検索 - 構成要素生物種 Escherichia coli (大腸菌)手法 X線回折 / シンクロトロン / 解像度 : 2 Å 詳細データ登録者 Bonanno, J.B. / Dickey, M. / Bain, K.T. / Eberle, M. / Ozyurt, S. / Smith, D. / Wasserman, S. / Sauder, J.M. / Burley, S.K. / Almo, S.C. / New York SGX Research Center for Structural Genomics (NYSGXRC) 引用ジャーナル : To be Published タイトル : Crystal structure of the N-terminal domain of UPF0209 protein yfcK from Escherichia coli O157:H7.著者 : Bonanno, J.B. / Dickey, M. / Bain, K.T. / Eberle, M. / Ozyurt, S. / Smith, D. / Wasserman, S. / Sauder, J.M. / Burley, S.K. / Almo, S.C. 履歴 登録 2007年8月13日 登録サイト : RCSB / 処理サイト : RCSB改定 1.0 2007年8月28日 Provider : repository / タイプ : Initial release改定 1.1 2011年7月13日 Group : Source and taxonomy / Version format compliance改定 1.2 2017年10月25日 Group : Refinement description / カテゴリ : software改定 1.3 2018年11月14日 Group : Data collection / Structure summary / カテゴリ : audit_author / Item : _audit_author.identifier_ORCID改定 1.4 2021年2月3日 Group : Database references / Structure summaryカテゴリ : audit_author / citation_author / struct_ref_seq_difItem : _audit_author.identifier_ORCID / _citation_author.identifier_ORCID / _struct_ref_seq_dif.details改定 1.5 2024年2月21日 Group : Data collection / Database references / カテゴリ : chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2Item : _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession
すべて表示 表示を減らす Remark 300 BIOMOLECULE: 1, 2 SEE REMARK 350 FOR THE AUTHOR PROVIDED AND PROGRAM GENERATED ASSEMBLY ... BIOMOLECULE: 1, 2 SEE REMARK 350 FOR THE AUTHOR PROVIDED AND PROGRAM GENERATED ASSEMBLY INFORMATION FOR THE STRUCTURE IN THIS ENTRY. THE REMARK MAY ALSO PROVIDE INFORMATION ON BURIED SURFACE AREA. AUTHORS STATE THAT THE DIMERIC ASSEMBLY SHOWN IN REMARK 350 IS PROBABLE.