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-基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 2py1 | ||||||
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タイトル | Solution structure of human liver fatty acid binding protein | ||||||
要素 | Fatty acid-binding protein, liver | ||||||
キーワード | LIPID BINDING PROTEIN / beta structure | ||||||
機能・相同性 | 機能・相同性情報 response to vitamin B3 / oleic acid binding / apical cortex / positive regulation of fatty acid beta-oxidation / bile acid binding / intestinal absorption / Heme degradation / long-chain fatty acid transmembrane transporter activity / heterocyclic compound binding / Triglyceride catabolism ...response to vitamin B3 / oleic acid binding / apical cortex / positive regulation of fatty acid beta-oxidation / bile acid binding / intestinal absorption / Heme degradation / long-chain fatty acid transmembrane transporter activity / heterocyclic compound binding / Triglyceride catabolism / antioxidant activity / peroxisomal matrix / fatty acid transport / Regulation of lipid metabolism by PPARalpha / fatty acid binding / negative regulation of cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process / phospholipid binding / PPARA activates gene expression / Cytoprotection by HMOX1 / cellular response to hydrogen peroxide / cellular response to hypoxia / chromatin binding / negative regulation of apoptotic process / protein-containing complex / extracellular exosome / 核質 / 細胞核 / 細胞質基質 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | Homo sapiens (ヒト) | ||||||
手法 | 溶液NMR | ||||||
データ登録者 | Long, D. / Yang, D. | ||||||
引用 | ジャーナル: J.Am.Chem.Soc. / 年: 2007 タイトル: Rapid data collection for protein structure determination by NMR spectroscopy. 著者: Xu, Y. / Long, D. / Yang, D. | ||||||
履歴 |
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-構造の表示
構造ビューア | 分子: MolmilJmol/JSmol |
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-ダウンロードとリンク
-ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | 2py1.cif.gz | 399.8 KB | 表示 | PDBx/mmCIF形式 |
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PDB形式 | pdb2py1.ent.gz | 331.3 KB | 表示 | PDB形式 |
PDBx/mmJSON形式 | 2py1.json.gz | ツリー表示 | PDBx/mmJSON形式 | |
その他 | その他のダウンロード |
-検証レポート
アーカイブディレクトリ | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/py/2py1 ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/py/2py1 | HTTPS FTP |
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-関連構造データ
-リンク
-集合体
登録構造単位 |
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1 |
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NMR アンサンブル |
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-要素
#1: タンパク質 | 分子量: 14370.496 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Homo sapiens (ヒト) / 遺伝子: FABP1, FABPL / 器官: liver肝臓 / プラスミド: pET-m / 生物種 (発現宿主): Escherichia coli / 発現宿主: Escherichia coli BL21 (大腸菌) / 株 (発現宿主): BL21 / 参照: UniProt: P07148 |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: 溶液NMR |
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NMR実験 | タイプ: 4D NOESY |
-試料調製
詳細 | 内容: 0.5mM LFABP, 50mM NaCl, 1mM EDTA, 90% H2O, 10% D2O / 溶媒系: 90% H2O/10% D2O |
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試料状態 | pH: 6.5 / 圧: 1 atm / 温度: 298 K |
-NMR測定
NMRスペクトロメーター | タイプ: Bruker AVANCE / 製造業者: Bruker / モデル: AVANCE / 磁場強度: 500 MHz |
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-解析
NMR software |
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代表構造 | 選択基準: fewest violations | ||||||||||||
NMRアンサンブル | コンフォーマー選択の基準: target function / 計算したコンフォーマーの数: 100 / 登録したコンフォーマーの数: 10 |