登録情報 データベース : PDB / ID : 2phn 構造の表示 ダウンロードとリンクタイトル Crystal structure of an amide bond forming F420-gamma glutamyl ligase from Archaeoglobus fulgidus 要素F420-0:gamma-glutamyl ligase 詳細 キーワード LIGASE / gamma-glutamyl ligase / coenzyme F420 biosynthesis / amide bond forming enzyme / metal dependent / new fold / GDP binding / MCSG / Structural Genomics / PSI-2 / Protein Structure Initiative / Midwest Center for Structural Genomics機能・相同性 機能・相同性情報分子機能 ドメイン・相同性 構成要素
coenzyme F420-0:L-glutamate ligase / coenzyme F420-1:gamma-L-glutamate ligase / coenzyme F420-0:L-glutamate ligase activity / coenzyme F420-1:gamma-L-glutamate ligase activity / F420-0 metabolic process / GTP binding / metal ion binding 類似検索 - 分子機能 CofE-like / CofE-like fold / CofE-like domain / Coenzyme F420:L-glutamate ligase, archaeal / Coenzyme F420:L-glutamate ligase-like domain / Coenzyme F420:L-glutamate ligase / F420-0:Gamma-glutamyl ligase / 60s Ribosomal Protein L30; Chain: A; / Alpha-Beta Complex / 2-Layer Sandwich / Alpha Beta 類似検索 - ドメイン・相同性 ACETATE ION / GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE / : / Coenzyme F420:L-glutamate ligase 類似検索 - 構成要素生物種 Archaeoglobus fulgidus DSM 4304 (古細菌)手法 X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度 : 1.35 Å 詳細データ登録者 Nocek, B. / Evdokimova, E. / Kudritska, M. / Edwards, A. / Savchenko, A. / Joachimiak, A. / Midwest Center for Structural Genomics (MCSG) 引用ジャーナル : J.Mol.Biol. / 年 : 2007タイトル : Structure of an Amide Bond Forming F(420):gammagamma-glutamyl Ligase from Archaeoglobus Fulgidus - A Member of a New Family of Non-ribosomal Peptide Synthases.著者 : Nocek, B. / Evdokimova, E. / Proudfoot, M. / Kudritska, M. / Grochowski, L.L. / White, R.H. / Savchenko, A. / Yakunin, A.F. / Edwards, A. / Joachimiak, A. 履歴 登録 2007年4月11日 登録サイト : RCSB / 処理サイト : RCSB改定 1.0 2007年5月15日 Provider : repository / タイプ : Initial release改定 1.1 2008年5月1日 Group : Version format compliance改定 1.2 2011年7月13日 Group : Non-polymer description / Version format compliance改定 1.3 2011年10月19日 Group : Derived calculations改定 1.4 2023年8月30日 Group : Data collection / Database references ... Data collection / Database references / Derived calculations / Refinement description カテゴリ : chem_comp_atom / chem_comp_bond ... chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model / pdbx_struct_conn_angle / struct_conn / struct_ref_seq_dif / struct_site Item : _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ... _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_atom_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_atom_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.value / _struct_conn.pdbx_dist_value / _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag / _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr1_label_asym_id / _struct_conn.ptnr1_label_atom_id / _struct_conn.ptnr1_label_comp_id / _struct_conn.ptnr1_label_seq_id / _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr2_label_asym_id / _struct_conn.ptnr2_label_atom_id / _struct_conn.ptnr2_label_comp_id / _struct_ref_seq_dif.details / _struct_site.pdbx_auth_asym_id / _struct_site.pdbx_auth_comp_id / _struct_site.pdbx_auth_seq_id 改定 1.5 2023年12月27日 Group : Derived calculations / カテゴリ : struct_conn / struct_conn_type
すべて表示 表示を減らす Remark 300 BIOMOLECULE: 1 THIS ENTRY CONTAINS THE CRYSTALLOGRAPHIC ASYMMETRIC UNIT WHICH CONSISTS OF 2 ... BIOMOLECULE: 1 THIS ENTRY CONTAINS THE CRYSTALLOGRAPHIC ASYMMETRIC UNIT WHICH CONSISTS OF 2 CHAIN(S). SEE REMARK 350 FOR INFORMATION ON GENERATING THE BIOLOGICAL MOLECULE(S). AUTHORS STATE THAT THE BIOLOGICAL UNIT ASSEMBLY HAS BEEN CONFIRMED BY GEL FILTRATION.