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基本情報
登録情報
データベース: PDB / ID: 2nrq
タイトル
Crystal structure of protein SSO0741 from Sulfolobus solfataricus, Pfam DUF54
要素
Hypothetical protein ORF-c20_032
キーワード
STRUCTURAL GENOMICS / UNKNOWN FUNCTION / conserved hypothetical protein / Sulfolobus solfataricus / 10077c / PSI / Protein Structure Initiative / New York SGX Research Center for Structural Genomics / NYSGXRC
機能・相同性
Uncharacterised protein family UPF0201 / RNA binding / 50s Ribosomal Protein L5; Chain: A, / Ribosomal protein L5 / Ribosomal protein L5 domain superfamily / 2-Layer Sandwich / Alpha Beta / RNA-binding protein
解像度: 2.5→2.59 Å / 冗長度: 8.2 % / Rmerge(I) obs: 0.354 / Mean I/σ(I) obs: 3.5 / % possible all: 100
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解析
ソフトウェア
名称
バージョン
分類
CNS
1.1
精密化
CBASS
データ収集
HKL-2000
データ削減
SCALEPACK
データスケーリング
SOLVE
位相決定
精密化
構造決定の手法: 単波長異常分散 / 解像度: 2.6→27.43 Å / Rfactor Rfree error: 0.02 / Data cutoff high absF: 173184.86 / Data cutoff low absF: 0 / Isotropic thermal model: RESTRAINED / 交差検証法: THROUGHOUT / σ(F): 2 / 立体化学のターゲット値: Engh & Huber 詳細: the missing residues listed in Remark 465 are due to lack of electron density; Residues with missing atoms as listed in Remark 470 were modeled as ALA because of lack of electron density for side chain atoms.