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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 2nmb | ||||||
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タイトル | DNUMB PTB DOMAIN COMPLEXED WITH A PHOSPHOTYROSINE PEPTIDE, NMR, ENSEMBLE OF STRUCTURES. | ||||||
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![]() | CELL CYCLE/GENE REGULATION / COMPLEX / SIGNAL TRANSDUCTION / PHOSPHOTYROSINE BINDING DOMAIN (PTB) / ASYMETR IC CELL DIVISION / CELL CYCLE-GENE REGULATION COMPLEX | ||||||
機能・相同性 | ![]() pericardial nephrocyte differentiation / enteroendocrine cell differentiation / Malpighian tubule tip cell differentiation / regulation of nervous system development / sensory organ precursor cell fate determination / sensory organ precursor cell division / neuroblast development / muscle cell fate specification / regulation of asymmetric cell division / regulation of neuroblast proliferation ...pericardial nephrocyte differentiation / enteroendocrine cell differentiation / Malpighian tubule tip cell differentiation / regulation of nervous system development / sensory organ precursor cell fate determination / sensory organ precursor cell division / neuroblast development / muscle cell fate specification / regulation of asymmetric cell division / regulation of neuroblast proliferation / negative regulation of receptor recycling / glial cell migration / asymmetric neuroblast division / basal part of cell / embryonic heart tube development / Notch binding / centrosome localization / positive regulation of neurogenesis / negative regulation of neuroblast proliferation / negative regulation of Notch signaling pathway / positive regulation of endocytosis / regulation of neurogenesis / neuroblast proliferation / protein localization / cell cortex / negative regulation of gene expression / ATP binding / nucleus / cytoplasm 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | ![]() ![]() | ||||||
手法 | 溶液NMR / SIMULATED ANNEALING WITH AMBIGUOUS RESTRAINTS | ||||||
![]() | Li, S.-C. / Zwahlen, C. / Vincent, S.J.F. / McGlade, C.J. / Pawson, T. / Forman-Kay, J.D. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: Structure of a Numb PTB domain-peptide complex suggests a basis for diverse binding specificity. 著者: Li, S.C. / Zwahlen, C. / Vincent, S.J. / McGlade, C.J. / Kay, L.E. / Pawson, T. / Forman-Kay, J.D. #1: ![]() タイトル: High-Affinity Binding of the Drosophila Numb Phosphotyrosine-Binding Domain to Pep Tides Containing a Gly-Pro-(P)Tyr Motif 著者: Li, S.-C. / Songyang, Z. / Vincent, S.J.F. / Zwahlen, C. / Wiley, S. / Cantley, L. / Kay, L.E. / Forman-Kay, J.D. / Pawson, T. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 666.2 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 552.3 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 366.7 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 599 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 56.9 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 71.4 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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NMR アンサンブル |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 17914.402 Da / 分子数: 1 / 断片: PTB DOMAIN / 由来タイプ: 組換発現 由来: (組換発現) ![]() ![]() 遺伝子: NUMB / プラスミド: PGEX4T2 / 生物種 (発現宿主): Escherichia coli / 発現宿主: ![]() ![]() |
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#2: タンパク質・ペプチド | 分子量: 875.902 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 合成 / 詳細: CHEMICALLY SYNTHESIZED |
-実験情報
-実験
実験 | 手法: 溶液NMR | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NMR実験 |
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NMR実験の詳細 | Text: NOE MIXING TIME 50MS AND 90MS FOR N-NOESY-HSQC, C-HSQC-NOESY, CN-NOESY NOE MIXING TIME 150MS FOR HALF-FILTER-NOESY,FILTER-NOESY |
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試料調製
試料状態 | pH: 6.0 / 圧: 1 atm / 温度: 303 K |
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結晶化 | *PLUS 手法: other / 詳細: NMR |
-NMR測定
NMRスペクトロメーター |
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解析
NMR software |
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精密化 | 手法: SIMULATED ANNEALING WITH AMBIGUOUS RESTRAINTS / ソフトェア番号: 1 詳細: MODIFICATION OF X-PLOR TO INCORPORATE ARIA PROTOCOL FOR AMBIGUOUS NOE ASSIGNMENT. | ||||||||||||
NMRアンサンブル | コンフォーマー選択の基準: NO NOE VIOLATION > 0.3 A 計算したコンフォーマーの数: 200 / 登録したコンフォーマーの数: 14 |