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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 2nde | ||||||
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タイトル | Solution Structure of Mutant of BMAP-28(1-18) | ||||||
![]() | Cathelicidin-5 | ||||||
![]() | ANTIMICROBIAL PROTEIN / AMP | ||||||
機能・相同性 | ![]() lipopolysaccharide binding / antimicrobial humoral immune response mediated by antimicrobial peptide / defense response to Gram-negative bacterium / defense response to Gram-positive bacterium / innate immune response / extracellular space 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | ![]() ![]() | ||||||
手法 | 溶液NMR / molecular dynamics | ||||||
Model details | lowest energy, model1 | ||||||
![]() | Agadi, N. / Kumar, A. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: Structure, Function And Membrane Interaction Studies of Two Synthetic Peptides Using Solution And Solid State NMR 著者: Agadi, N. / Kumar, A. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 68.8 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 51.3 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
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-関連構造データ
関連構造データ | |
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類似構造データ | |
その他のデータベース |
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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NMR アンサンブル |
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要素
#1: タンパク質・ペプチド | 分子量: 1999.494 Da / 分子数: 1 / 断片: UNP residues 132-149 / 変異: G1I/S5G/L11A/R12L/W14H / 由来タイプ: 合成 / 由来: (合成) ![]() ![]() |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: 溶液NMR | ||||||||||||||||||||
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NMR実験 |
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試料調製
詳細 | 内容: 20 mM sodium phosphate-1, 10 % [U-99% 2H] D2O-2, 90 % H2O-3, 50 mM [U-99% 2H] SDS-4, 90% H2O/10% D2O 溶媒系: 90% H2O/10% D2O | ||||||||||||||||||||
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試料 |
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試料状態 | イオン強度: 0 / pH: 6.6 / 圧: ambient / 温度: 298 K |
-NMR測定
NMRスペクトロメーター |
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解析
NMR software |
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精密化 | 手法: molecular dynamics / ソフトェア番号: 1 | |||||||||||||||
代表構造 | 選択基準: lowest energy | |||||||||||||||
NMRアンサンブル | コンフォーマー選択の基準: target function / 計算したコンフォーマーの数: 200 / 登録したコンフォーマーの数: 10 / 代表コンフォーマー: 1 |