内容: 1.5 mM [U-13C; U-15N] protein, 150 mM sodium chloride, 10 mM DTT, 0.05 % sodium azide, 0.2 mM PMSF, 1 mM EDTA, 93% H2O/7% D2O 溶媒系: 93% H2O/7% D2O
試料
濃度 (mg/ml)
構成要素
Isotopic labeling
Solution-ID
1.5mM
entity-1
[U-13C; U-15N]
1
150mM
sodium chloride-2
1
10mM
DTT-3
1
0.05 %
sodium azide-4
1
0.2mM
PMSF-5
1
1mM
EDTA-6
1
試料状態
pH: 7.0 / 圧: ambient / 温度: 298 K
-
NMR測定
NMRスペクトロメーター
タイプ
製造業者
モデル
磁場強度 (MHz)
Spectrometer-ID
Bruker Avance
Bruker
AVANCE
1000
1
Bruker Avance
Bruker
AVANCE
800
2
-
解析
NMR software
名称
バージョン
開発者
分類
X-PLOR NIH
Schwieters, Kuszewski, TjandraandClore
構造決定
Amber
Case, Darden, Cheatham, III, Simmerling, Wang, Duke, Luo, ... andKollman
精密化
CARA
KellerandWuthrich
chemicalshiftassignment
CYANA
2.1
Guntert, MumenthalerandWuthrich
構造決定
UNIO'10
2.02
(UNIO)TorstenHerrmann
構造決定
TopSpin
BrukerBiospin
解析
精密化
手法: simulated annealing / ソフトェア番号: 1
NMR constraints
NOE constraints total: 1237 / NOE intraresidue total count: 276 / NOE long range total count: 264 / NOE medium range total count: 243 / NOE sequential total count: 454 / Protein phi angle constraints total count: 115 / Protein psi angle constraints total count: 120
代表構造
選択基準: lowest energy
NMRアンサンブル
コンフォーマー選択の基準: structures with the lowest energy 計算したコンフォーマーの数: 100 / 登録したコンフォーマーの数: 20