+
データを開く
-
基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 2muz | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
タイトル | ssNMR structure of a designed rocker protein | ||||||
![]() | designed rocker protein | ||||||
![]() | DE NOVO PROTEIN / ssNMR / Rocker protein / DE NOVO desgin | ||||||
生物種 | synthetic construct (人工物) | ||||||
手法 | 溶液NMR / Torsion angles ajustments using Chimera, Pymol, CODEX data fitting by Matlab. | ||||||
![]() | Wang, T. / Joh, N. / Wu, Y. / DeGrado, W.F. / Hong, M. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: De novo design of a transmembrane Zn2+-transporting four-helix bundle. 著者: Joh, N.H. / Wang, T. / Bhate, M.P. / Acharya, R. / Wu, Y. / Grabe, M. / Hong, M. / Grigoryan, G. / DeGrado, W.F. | ||||||
履歴 |
|
-
構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
---|
-
ダウンロードとリンク
-
ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 18.9 KB | 表示 | ![]() |
---|---|---|---|---|
PDB形式 | ![]() | 13.1 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 342.6 KB | 表示 | ![]() |
---|---|---|---|---|
文書・詳細版 | ![]() | 343.2 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 3.6 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 4.8 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
-
リンク
-
集合体
登録構造単位 | ![]()
| |||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
1 |
| |||||||||
NMR アンサンブル |
|
-
要素
#1: タンパク質・ペプチド | 分子量: 2971.427 Da / 分子数: 4 / 由来タイプ: 合成 / 由来: (合成) synthetic construct (人工物) |
---|
-実験情報
-実験
実験 | 手法: 溶液NMR |
---|---|
NMR実験 | タイプ: 19F CODEX |
-
試料調製
詳細 | 内容: 1.5 mg/mL protein, 100% H2O / 溶媒系: 100% H2O |
---|---|
試料 | 濃度: 1.5 mg/mL / 構成要素: entity_1-1 / Isotopic labeling: F19 on Phe 14 |
試料状態 | イオン強度: 0.02 / pH: 7.0 / 圧: ambient / 温度: 220 K |
-NMR測定
NMRスペクトロメーター | タイプ: Bruker DSX / 製造業者: Bruker / モデル: DSX / 磁場強度: 400 MHz |
---|
-
解析
NMR software |
| ||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
精密化 | 手法: Torsion angles ajustments using Chimera, Pymol, CODEX data fitting by Matlab. ソフトェア番号: 1 | ||||||||||||
代表構造 | 選択基準: fewest violations | ||||||||||||
NMRアンサンブル | コンフォーマー選択の基準: structures with the least restraint violations 計算したコンフォーマーの数: 1 / 登録したコンフォーマーの数: 1 |