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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 2mga | ||||||
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タイトル | HIGH RESOLUTION CRYSTAL STRUCTURES OF FIVE DISTAL HISTIDINE MUTANTS OF SPERM WHALE MYOGLOBIN | ||||||
![]() | MYOGLOBIN | ||||||
![]() | OXYGEN STORAGE | ||||||
機能・相同性 | ![]() 酸化還元酵素; 他の含窒素化合物が電子供与する / nitrite reductase activity / sarcoplasm / 酸化還元酵素; 過酸化物を電子受容体にする; ペルオキシダーゼ / removal of superoxide radicals / oxygen carrier activity / peroxidase activity / oxygen binding / heme binding / extracellular exosome / metal ion binding 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | ![]() ![]() | ||||||
手法 | ![]() | ||||||
![]() | Quillin, M.L. / Arduini, R.M. / Phillips Jr., G.N. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: High-resolution crystal structures of distal histidine mutants of sperm whale myoglobin. 著者: Quillin, M.L. / Arduini, R.M. / Olson, J.S. / Phillips Jr., G.N. #1: ![]() タイトル: Crystal Structure of Myoglobin from a Synthetic Gene 著者: Phillips Jr., G.N. / Arduini, R.M. / Springer, B.A. / Sligar, S.G. #2: ![]() タイトル: High-Level Expression of Sperm Whale Myoglobin in Escherichia Coli 著者: Springer, B.A. / Sligar, S.G. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 49 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 34.3 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
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-関連構造データ
関連構造データ | ![]() 1mobC ![]() 1mocC ![]() 1modC ![]() 2mgbC ![]() 2mgcC ![]() 2mgdC ![]() 2mgeC ![]() 2mgfC ![]() 2mggC ![]() 2mghC ![]() 2mgiC ![]() 2mgjC ![]() 2mgkC ![]() 2mglC ![]() 2mgmC C: 同じ文献を引用 ( |
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類似構造データ |
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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単位格子 |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 17284.068 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 由来: (組換発現) ![]() ![]() 遺伝子: SYNTHETIC GENE / 参照: UniProt: P02185 |
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#2: 化合物 | ChemComp-SO4 / |
#3: 化合物 | ChemComp-HEM / |
#4: 化合物 | ChemComp-CMO / |
#5: 水 | ChemComp-HOH / |
-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 3.19 Å3/Da / 溶媒含有率: 61.38 % | |||||||||||||||||||||||||
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結晶化 | *PLUS pH: 9 / 手法: batch method / 詳細: micro seeding | |||||||||||||||||||||||||
溶液の組成 | *PLUS
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解析
ソフトウェア | 名称: PROFFT / 分類: 精密化 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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精密化 | 解像度: 2.2→5 Å /
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精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 2.2→5 Å
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拘束条件 |
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ソフトウェア | *PLUS 名称: PROFFT / 分類: refinement | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
精密化 | *PLUS 最高解像度: 2.2 Å / 最低解像度: 5 Å / Num. reflection obs: 7952 / Rfactor obs: 0.137 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
溶媒の処理 | *PLUS | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
原子変位パラメータ | *PLUS |