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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 2m1g | ||||||||||||||||||||
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タイトル | Parallel human telomeric quadruplex containing 2'F-ANA substitutions | ||||||||||||||||||||
![]() | 5'-D(*![]() DNA / parallel G-quadruplex / human telomeric sequence / fluoro-arabinose / molecular interactions | 機能・相同性 | DNA / DNA (> 10) | ![]() 手法 | 溶液NMR / molecular dynamics, simulated annealing | Model details | closest to the average | ![]() Martin-Pintado, N. / Yahyaee-Anzahaee, M. / Deleavey, G.F. / Portella, G. / Orozco, M. / Damha, M.J. / Gonzalez, C. | ![]() ![]() タイトル: Dramatic effect of furanose c2' substitution on structure and stability: directing the folding of the human telomeric quadruplex with a single fluorine atom. 著者: Martin-Pintado, N. / Yahyaee-Anzahaee, M. / Deleavey, G.F. / Portella, G. / Orozco, M. / Damha, M.J. / Gonzalez, C. 履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 158.1 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 127.9 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
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-関連構造データ
類似構造データ | |
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その他のデータベース |
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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NMR アンサンブル |
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要素
#1: DNA鎖 | 分子量: 3791.453 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 合成 |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: 溶液NMR | ||||||||||||||||||||
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NMR実験 |
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試料調製
詳細 |
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試料 |
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試料状態 | イオン強度: 15 / pH: 7 / 圧: ambient / 温度: 278 K |
-NMR測定
NMRスペクトロメーター |
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解析
NMR software |
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精密化 | 手法: molecular dynamics, simulated annealing / ソフトェア番号: 1 | |||||||||||||||||||||
代表構造 | 選択基準: closest to the average | |||||||||||||||||||||
NMRアンサンブル | コンフォーマー選択の基準: structures with the lowest energy 計算したコンフォーマーの数: 20 / 登録したコンフォーマーの数: 10 |