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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 2lwg | ||||||||||||||||||||||
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タイトル | NMR Structure of the Self-Complementary 10 mer DNA Oligonucleotide 5'-GGATATATCC-3'. | ||||||||||||||||||||||
![]() | DNA (5'-D(*![]() DNA / DNA microstructure / Induced DNA binding / DNA minor groove variations | 機能・相同性 | DNA | ![]() 手法 | 溶液NMR / simulated annealing, molecular dynamics | Model details | minimized average structure, model 1 | Model type details | minimized average | ![]() Rettig, M. / Germann, M.W. / Wilson, W. / Wang, S. | ![]() ![]() タイトル: Molecular basis for sequence-dependent induced DNA bending. 著者: Rettig, M. / Germann, M.W. / Wang, S. / Wilson, W.D. 履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 139.8 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 113.2 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 322.7 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 417.1 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 7.1 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 11.2 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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NMR アンサンブル |
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要素
#1: DNA鎖 | 分子量: 3044.017 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 合成 |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: 溶液NMR | ||||||||||||||||||||||||||||
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NMR実験 |
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試料調製
詳細 |
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試料 |
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試料状態 | pH: 7 / 圧: ambient / 温度: 278 K |
-NMR測定
NMRスペクトロメーター |
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解析
NMR software |
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精密化 | 手法: simulated annealing, molecular dynamics / ソフトェア番号: 1 | ||||||||||||
代表構造 | 選択基準: minimized average structure | ||||||||||||
NMRアンサンブル | コンフォーマー選択の基準: target function / 計算したコンフォーマーの数: 5000 / 登録したコンフォーマーの数: 11 |