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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 2lug | ||||||
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タイトル | Solution NMR structure of a S72-S107 peptide of 18.5kDa murine myelin basic protein (MBP) in association with dodecylphosphocholine micelles | ||||||
![]() | Myelin basic protein | ||||||
![]() | LIPID BINDING PROTEIN / intrinsically disordered proteins / dodecylphosphocholine micelles / myelin membrane | ||||||
機能・相同性 | ![]() compact myelin / structural constituent of myelin sheath / internode region of axon / negative regulation of heterotypic cell-cell adhesion / membrane organization / positive regulation of chemokine (C-X-C motif) ligand 2 production / maintenance of blood-brain barrier / myelination / cell periphery / cell projection ...compact myelin / structural constituent of myelin sheath / internode region of axon / negative regulation of heterotypic cell-cell adhesion / membrane organization / positive regulation of chemokine (C-X-C motif) ligand 2 production / maintenance of blood-brain barrier / myelination / cell periphery / cell projection / sensory perception of sound / positive regulation of interleukin-6 production / response to toxic substance / MAPK cascade / myelin sheath / protease binding / calmodulin binding / neuronal cell body / protein-containing complex / nucleus / plasma membrane / cytoplasm 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | ![]() ![]() | ||||||
手法 | 溶液NMR / torsion angle dynamics | ||||||
![]() | Ahmed, M.A.M. / De Avila, M. / Polverini, E. / Bessonov, K. / Bamm, V.V. / Harauz, G. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: Solution Nuclear Magnetic Resonance Structure and Molecular Dynamics Simulations of a Murine 18.5 kDa Myelin Basic Protein Segment (S72-S107) in Association with Dodecylphosphocholine Micelles. 著者: Ahmed, M.A. / De Avila, M. / Polverini, E. / Bessonov, K. / Bamm, V.V. / Harauz, G. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 120.2 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 96.4 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 466.9 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 509 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 10.1 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 13.1 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
類似構造データ | |
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その他のデータベース |
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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NMR アンサンブル |
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要素
#1: タンパク質・ペプチド | 分子量: 3977.424 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) ![]() ![]() ![]() ![]() |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: 溶液NMR | ||||||||||||||||||||||||||||||||
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NMR実験 |
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試料調製
詳細 | 内容: 1.47 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] S72-S107 MBP peptide, 50 mM potassium phosphate, 100 mM Deuterated Dodecylphosphocholine, 90% H2O/10% D2O 溶媒系: 90% H2O/10% D2O | ||||||||||||||||
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試料 |
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試料状態 | pH: 6.5 / 圧: ambient / 温度: 285 K |
-NMR測定
NMRスペクトロメーター | タイプ: Bruker Avance / 製造業者: Bruker / モデル: AVANCE / 磁場強度: 600 MHz |
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解析
NMR software |
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精密化 | 手法: torsion angle dynamics / ソフトェア番号: 1 | |||||||||||||||||||||
代表構造 | 選択基準: lowest energy | |||||||||||||||||||||
NMRアンサンブル | コンフォーマー選択の基準: structures with the lowest energy 計算したコンフォーマーの数: 10500 / 登録したコンフォーマーの数: 10 |