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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 2lu2 | ||||||
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タイトル | MIC5 regulates the activity of Toxoplasma subtilisin 1 by mimicking a subtilisin prodomain | ||||||
![]() | Microneme TgMIC5 protein | ||||||
![]() | CELL ADHESION / Micronemal Protein 5 / invasion / pathogenesis | ||||||
機能・相同性 | Alpha-Beta Plaits - #2380 / Alpha-Beta Plaits / 2-Layer Sandwich / Alpha Beta / : ![]() | ||||||
生物種 | ![]() ![]() | ||||||
手法 | 溶液NMR / simulated annealing | ||||||
Model details | lowest energy, model 2 | ||||||
![]() | Saouros, S. / Dou, Z. / Henry, M. / Marchant, J. / Carruthers, V.B. / Matthews, S. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: Microneme protein 5 regulates the activity of toxoplasma subtilisin 1 by mimicking a subtilisin prodomain. 著者: Saouros, S. / Dou, Z. / Henry, M. / Marchant, J. / Carruthers, V.B. / Matthews, S. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 272.3 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 225.5 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 529.4 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 1.1 MB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 110 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 80.2 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
類似構造データ | |
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その他のデータベース |
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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NMR アンサンブル |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 15272.904 Da / 分子数: 1 / 断片: UNP residues 98-235 / 由来タイプ: 組換発現 由来: (組換発現) ![]() ![]() 遺伝子: TGME49_077080, TGVEG_027740 / 発現宿主: ![]() ![]() |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: 溶液NMR | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NMR実験 |
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試料調製
詳細 | 内容: 1 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] Tg Micronemal Protein 5, 25 mM potassium phosphate, 100 mM sodium chloride, 90% H2O/10% D2O 溶媒系: 90% H2O/10% D2O | ||||||||||||||||
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試料 |
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試料状態 | イオン強度: 0.1 / pH: 7.2 / 圧: ambient / 温度: 303 K |
-NMR測定
NMRスペクトロメーター |
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解析
NMR software |
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精密化 | 手法: simulated annealing / ソフトェア番号: 1 / 詳細: REFINED IN EXPLICIT WATER | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
代表構造 | 選択基準: lowest energy | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NMRアンサンブル | コンフォーマー選択の基準: structures with the lowest energy 計算したコンフォーマーの数: 100 / 登録したコンフォーマーの数: 10 |