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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 2lsc | ||||||||||||||||||||
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タイトル | Solution structure of 2'F-ANA and ANA self-complementary duplex | ||||||||||||||||||||
![]() | DNA (5'-D(*![]() DNA / Dickerson Drew dodecamer | 機能・相同性 | DNA / DNA (> 10) | ![]() 手法 | 溶液NMR / molecular dynamics | Model details | closest to the average, model 13 | ![]() Martin-Pintado, N. / Yahyaee, M. / Campos, R. / Noronha, A. / Wilds, C. / Damha, M. / Gonzalez, C. | ![]() ![]() タイトル: The solution structure of double helical arabino nucleic acids (ANA and 2'F-ANA): effect of arabinoses in duplex-hairpin interconversion. 著者: Martin-Pintado, N. / Yahyaee-Anzahaee, M. / Campos-Olivas, R. / Noronha, A.M. / Wilds, C.J. / Damha, M.J. / Gonzalez, C. 履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 296 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 251.5 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 431.7 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 644.5 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 28.4 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 32.6 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
類似構造データ | |
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その他のデータベース |
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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NMR アンサンブル |
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要素
#1: DNA鎖 | 分子量: 3843.264 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 合成 |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: 溶液NMR | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NMR実験 |
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試料調製
詳細 |
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試料 |
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試料状態 |
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-NMR測定
NMRスペクトロメーター |
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解析
NMR software |
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精密化 | 手法: molecular dynamics / ソフトェア番号: 1 | |||||||||||||||
NMR constraints | NOE constraints total: 194 / NOE intraresidue total count: 83 / NOE long range total count: 32 / NOE sequential total count: 61 / Hydrogen bond constraints total count: 64 | |||||||||||||||
代表構造 | 選択基準: closest to the average | |||||||||||||||
NMRアンサンブル | コンフォーマー選択の基準: structures with the lowest energy 計算したコンフォーマーの数: 30 / 登録したコンフォーマーの数: 20 |