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-基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 2lr7 | ||||||
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タイトル | Cathelicidin-PY | ||||||
要素 | Cathelicidin-PY | ||||||
キーワード | UNKNOWN FUNCTION | ||||||
機能・相同性 | Cathelicidin-PY 機能・相同性情報 | ||||||
生物種 | Rana catesbeiana (カエル) | ||||||
手法 | 溶液NMR / distance geometry | ||||||
Model details | closest to the average, model 1 | ||||||
データ登録者 | Yang, J. | ||||||
引用 | ジャーナル: To be Published タイトル: Structure of Cathelicidin-PY 著者: Yang, J. / Wei, L. | ||||||
履歴 |
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-構造の表示
構造ビューア | 分子: MolmilJmol/JSmol |
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-ダウンロードとリンク
-ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | 2lr7.cif.gz | 221.8 KB | 表示 | PDBx/mmCIF形式 |
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PDB形式 | pdb2lr7.ent.gz | 193.9 KB | 表示 | PDB形式 |
PDBx/mmJSON形式 | 2lr7.json.gz | ツリー表示 | PDBx/mmJSON形式 | |
その他 | その他のダウンロード |
-検証レポート
文書・要旨 | 2lr7_validation.pdf.gz | 381.1 KB | 表示 | wwPDB検証レポート |
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文書・詳細版 | 2lr7_full_validation.pdf.gz | 489.2 KB | 表示 | |
XML形式データ | 2lr7_validation.xml.gz | 13.6 KB | 表示 | |
CIF形式データ | 2lr7_validation.cif.gz | 20.8 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/lr/2lr7 ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/lr/2lr7 | HTTPS FTP |
-関連構造データ
類似構造データ | |
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その他のデータベース |
-リンク
-集合体
登録構造単位 |
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1 |
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NMR アンサンブル |
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-要素
#1: タンパク質・ペプチド | 分子量: 3434.196 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Rana catesbeiana (カエル) / 発現宿主: Escherichia coli (大腸菌) / 参照: UniProt: M9MMP3*PLUS |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: 溶液NMR | ||||||||||||
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NMR実験 |
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-試料調製
詳細 | 内容: 10% mM [U-2H] D2O-1, 90% H2O/10% D2O / 溶媒系: 90% H2O/10% D2O |
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試料 | 濃度: 0.1 mM / 構成要素: D2O-1 / Isotopic labeling: [U-2H] |
試料状態 | イオン強度: 0.0001 / pH: 6.2 / 圧: ambient / 温度: 25 K |
-NMR測定
NMRスペクトロメーター | タイプ: Bruker Avance / 製造業者: Bruker / モデル: Avance / 磁場強度: 600 MHz |
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-解析
NMR software |
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精密化 | 手法: distance geometry / ソフトェア番号: 1 | |||||||||
代表構造 | 選択基準: closest to the average | |||||||||
NMRアンサンブル | コンフォーマー選択の基準: structures with the lowest energy 計算したコンフォーマーの数: 200 / 登録したコンフォーマーの数: 20 / 代表コンフォーマー: 20 |