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-基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 2lpv | ||||||
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タイトル | Solution Structure of FKBP12 from Aedes aegypti | ||||||
要素 | FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase | ||||||
キーワード | ISOMERASE / FKBP12 | ||||||
機能・相同性 | 機能・相同性情報 | ||||||
生物種 | Aedes aegypti (ネッタイシマカ) | ||||||
手法 | 溶液NMR / simulated annealing | ||||||
Model details | lowest energy, model 1 | ||||||
データ登録者 | Chakraborty, G. / Shin, J. | ||||||
引用 | ジャーナル: Proteins / 年: 2012 タイトル: Solution structure of FK506-binding protein 12 from Aedes aegypti. 著者: Chakraborty, G. / Shin, J. / Nguyen, Q.T. / Harikishore, A. / Baek, K. / Yoon, H.S. | ||||||
履歴 |
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-構造の表示
構造ビューア | 分子: MolmilJmol/JSmol |
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-ダウンロードとリンク
-ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | 2lpv.cif.gz | 627.3 KB | 表示 | PDBx/mmCIF形式 |
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PDB形式 | pdb2lpv.ent.gz | 524.4 KB | 表示 | PDB形式 |
PDBx/mmJSON形式 | 2lpv.json.gz | ツリー表示 | PDBx/mmJSON形式 | |
その他 | その他のダウンロード |
-検証レポート
文書・要旨 | 2lpv_validation.pdf.gz | 459.8 KB | 表示 | wwPDB検証レポート |
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文書・詳細版 | 2lpv_full_validation.pdf.gz | 602.7 KB | 表示 | |
XML形式データ | 2lpv_validation.xml.gz | 38.9 KB | 表示 | |
CIF形式データ | 2lpv_validation.cif.gz | 58.8 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/lp/2lpv ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/lp/2lpv | HTTPS FTP |
-関連構造データ
類似構造データ | |
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その他のデータベース |
-リンク
-集合体
登録構造単位 |
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1 |
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NMR アンサンブル |
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-要素
#1: タンパク質 | 分子量: 11553.063 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 由来: (組換発現) Aedes aegypti (ネッタイシマカ) 遺伝子: AAEL007883, AaeL_AAEL007883 / 発現宿主: Escherichia coli (大腸菌) / 参照: UniProt: Q1HR83 |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: 溶液NMR | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NMR実験 |
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-試料調製
詳細 |
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試料 |
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試料状態 | pH: 7 / 圧: ambient / 温度: 298 K |
-NMR測定
NMRスペクトロメーター |
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-解析
NMR software |
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精密化 | 手法: simulated annealing / ソフトェア番号: 1 | |||||||||||||||||||||||||||
代表構造 | 選択基準: lowest energy | |||||||||||||||||||||||||||
NMRアンサンブル | コンフォーマー選択の基準: structures with the lowest energy 計算したコンフォーマーの数: 100 / 登録したコンフォーマーの数: 20 / 代表コンフォーマー: 1 |