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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 2l6i | ||||||||||||||||||
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タイトル | Solution structure of coronaviral stem-loop 2 (SL2) | ||||||||||||||||||
![]() | RNA (5'-R(*![]() RNA / RNA tetraloop / severe acute respiratory syndrome / mouse hepatitis virus / coronavirus | 機能・相同性 | RNA / RNA (> 10) | ![]() 手法 | 溶液NMR / DGSA-distance geometry simulated annealing, molecular dynamics | ![]() Lee, C. / Li, L. / Giedroc, D.P. | ![]() ![]() タイトル: The solution structure of coronaviral stem-loop 2 (SL2) reveals a canonical CUYG tetraloop fold. 著者: Lee, C.W. / Li, L. / Giedroc, D.P. 履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 258.3 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 217.1 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 323 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 433.2 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 8.4 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 14.7 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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NMR アンサンブル |
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要素
#1: RNA鎖 | 分子量: 5060.023 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 合成 |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: 溶液NMR | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NMR実験 |
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試料調製
詳細 |
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試料 |
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試料状態 |
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-NMR測定
NMRスペクトロメーター |
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解析
NMR software |
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精密化 | 手法: DGSA-distance geometry simulated annealing, molecular dynamics ソフトェア番号: 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
代表構造 | 選択基準: lowest energy | ||||||||||||||||||||||||||||||||
NMRアンサンブル | コンフォーマー選択の基準: structures with the lowest energy 計算したコンフォーマーの数: 100 / 登録したコンフォーマーの数: 27 |