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データを開く
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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 2l24 | ||||||
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タイトル | Antimicrobial peptide | ||||||
![]() | Hemagglutinin![]() | ||||||
![]() | ![]() ![]() ![]() ![]() | ||||||
機能・相同性 | ![]() clathrin-dependent endocytosis of virus by host cell / membrane => GO:0016020 / host cell surface receptor binding / apical plasma membrane / fusion of virus membrane with host plasma membrane / fusion of virus membrane with host endosome membrane / ![]() 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | ![]() ![]() ![]() | ||||||
手法 | ![]() ![]() | ||||||
Model details | fewest violations, model 1 | ||||||
![]() | Zhu, S. / Aumelas, A. / Gao, B. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: Convergent evolution-guided design of antimicrobial peptides derived from influenza A virus hemagglutinin. 著者: Zhu, S. / Aumelas, A. / Gao, B. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 40.2 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 29.2 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
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-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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NMR アンサンブル |
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要素
#1: タンパク質・ペプチド | ![]() 分子量: 1448.753 Da / 分子数: 1 / 断片: UNP residues 331-343 / 由来タイプ: 合成 / 詳細: The peptide was chemically synthesized. 由来: (合成) ![]() ![]() ![]() 参照: UniProt: Q6PP25 |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() | ||||||||||||||||
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NMR実験 |
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試料調製
詳細 | 内容: 1.5-2.0 mM HA-FD-13aG12I-1, 60% trifluoroethanol/40% water 溶媒系: 60% trifluoroethanol/40% water |
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試料 | 単位: mM / 構成要素: HA-FD-13aG12I-1 / Conc. range: 1.5-2.0 |
試料状態 | 圧: ambient / 温度: 295 K |
-NMR測定
NMRスペクトロメーター | タイプ: Bruker Avance / 製造業者: Bruker / モデル![]() |
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解析
NMR software |
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精密化 | 手法: ![]() | |||||||||||||||||||||||||||||||||
NMR constraints | Protein phi angle constraints total count: 8 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
代表構造 | 選択基準: fewest violations | |||||||||||||||||||||||||||||||||
NMRアンサンブル | コンフォーマー選択の基準: target function / 計算したコンフォーマーの数: 100 / 登録したコンフォーマーの数: 10 / Maximum lower distance constraint violation: 14 Å / Maximum upper distance constraint violation: 83 Å / 代表コンフォーマー: 1 |