0.7 mM [U-99% 13C; U-99% 15N] Bem1 SH3-CI protein, 1.5 mM Ste20 peptide, 0.5 mM PMSF, 0.5 mM EDTA, 0.05 % sodium azide, 50 mM HEPES, 100 mM sodium chloride, 1 mM DTT, 95% H2O/5% D2O
95% H2O/5% D2O
2
0.7 mM [U-99% 13C; U-99% 15N] Bem1 SH3-CI protein, 1.5 mM Ste20 peptide, 0.5 mM PMSF, 0.5 mM EDTA, 0.05 % sodium azide, 50 mM HEPES, 100 mM sodium chloride, 1 mM DTT, 100% D2O
100% D2O
3
0.5 mM [U-99% 13C; U-99% 15N] Bem1 SH3-CI protein, 0.5 mM Ste20 peptide, 100 mM sodium chloride, 50 mM sodium phosphate, 0.05 % sodium azide, 95% H2O/5% D2O
95% H2O/5% D2O
4
0.5 mM [U-99% 13C; U-99% 15N] Bem1 SH3-CI protein, 0.5 mM Ste20 peptide, 100 mM sodium chloride, 50 mM sodium phosphate, 0.05 % sodium azide, 100% D2O
100% D2O
試料
濃度 (mg/ml)
構成要素
Isotopic labeling
Solution-ID
0.7mM
Bem1 SH3-CI protein-1
[U-99% 13C; U-99% 15N]
1
1.5mM
Ste20 peptide-2
1
0.5mM
PMSF-3
1
0.5mM
EDTA-4
1
0.05 %
sodium azide-5
1
50mM
HEPES-6
1
100mM
sodium chloride-7
1
1mM
DTT-8
1
0.7mM
Bem1 SH3-CI protein-9
[U-99% 13C; U-99% 15N]
2
1.5mM
Ste20 peptide-10
2
0.5mM
PMSF-11
2
0.5mM
EDTA-12
2
0.05 %
sodium azide-13
2
50mM
HEPES-14
2
100mM
sodium chloride-15
2
1mM
DTT-16
2
0.5mM
Bem1 SH3-CI protein-17
[U-99% 13C; U-99% 15N]
3
0.5mM
Ste20 peptide-18
3
100mM
sodium chloride-19
3
50mM
sodium phosphate-20
3
0.05 %
sodium azide-21
3
0.5mM
Bem1 SH3-CI protein-22
[U-99% 13C; U-99% 15N]
4
0.5mM
Ste20 peptide-23
4
100mM
sodium chloride-24
4
50mM
sodium phosphate-25
4
0.05 %
sodium azide-26
4
試料状態
イオン強度: 100 / pH: 6.8 / 圧: ambient / 温度: 293 K
-
NMR測定
NMRスペクトロメーター
タイプ
製造業者
モデル
磁場強度 (MHz)
Spectrometer-ID
Varian INOVA
Varian
INOVA
500
1
Varian INOVA
Varian
INOVA
800
2
-
解析
NMR software
名称
バージョン
開発者
分類
Sparky
Goddard
chemicalshiftassignment
Sparky
Goddard
peakpicking
NMRPipe
Delaglio, Grzesiek, Vuister, Zhu, PfeiferandBax
解析
CYANA
2.1
Guntert, MumenthalerandWuthrich
構造決定
CYANA
2.1
Guntert, MumenthalerandWuthrich
精密化
精密化
手法: simulated annealing / ソフトェア番号: 1
NMR constraints
Protein chi angle constraints total count: 0 / Protein other angle constraints total count: 0 / Protein phi angle constraints total count: 71 / Protein psi angle constraints total count: 73
代表構造
選択基準: lowest energy
NMRアンサンブル
コンフォーマー選択の基準: target function / 計算したコンフォーマーの数: 100 / 登録したコンフォーマーの数: 20