登録情報 | データベース: PDB / ID: 2kxn |
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タイトル | NMR structure of human Tra2beta1 RRM in complex with AAGAAC RNA |
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要素 | - 5'-R(*AP*AP*GP*AP*AP*C)-3'
- Transformer-2 protein homolog beta
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キーワード | RNA binding protein/RNA / SR protein / RRM / splicing factor / RNA protein complex / SMN / RNA binding protein-RNA complex |
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機能・相同性 | 機能・相同性情報
cerebral cortex regionalization / embryonic brain development / pre-mRNA binding / RNA splicing, via transesterification reactions / positive regulation of mRNA splicing, via spliceosome / RHOBTB1 GTPase cycle / nuclear inner membrane / regulation of alternative mRNA splicing, via spliceosome / regulation of RNA splicing / Processing of Capped Intron-Containing Pre-mRNA ...cerebral cortex regionalization / embryonic brain development / pre-mRNA binding / RNA splicing, via transesterification reactions / positive regulation of mRNA splicing, via spliceosome / RHOBTB1 GTPase cycle / nuclear inner membrane / regulation of alternative mRNA splicing, via spliceosome / regulation of RNA splicing / Processing of Capped Intron-Containing Pre-mRNA / RHOBTB2 GTPase cycle / mRNA Splicing - Major Pathway / cellular response to glucose stimulus / spliceosomal complex / mRNA splicing, via spliceosome / protein domain specific binding / mRNA binding / protein-containing complex / RNA binding / nucleoplasm / identical protein binding / nucleus類似検索 - 分子機能 RRM (RNA recognition motif) domain / RNA recognition motif / RNA recognition motif / Eukaryotic RNA Recognition Motif (RRM) profile. / RNA recognition motif domain / RNA-binding domain superfamily / Nucleotide-binding alpha-beta plait domain superfamily / Alpha-Beta Plaits / 2-Layer Sandwich / Alpha Beta類似検索 - ドメイン・相同性 |
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生物種 | Homo sapiens (ヒト) |
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手法 | 溶液NMR / simulated annealing |
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Model details | lowest energy, model 1 |
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データ登録者 | Clery, A. / Jayne, S. / Benderska, N. / Dominguez, C. / Stamm, S. / Allain, F.H.-T. |
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引用 | ジャーナル: Nat.Struct.Mol.Biol. / 年: 2011 タイトル: Molecular basis of purine-rich RNA recognition by the human SR-like protein Tra2-beta1 著者: Clery, A. / Jayne, S. / Benderska, N. / Dominguez, C. / Stamm, S. / Allain, F.H. |
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履歴 | 登録 | 2010年5月10日 | 登録サイト: BMRB / 処理サイト: RCSB |
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改定 1.0 | 2011年3月16日 | Provider: repository / タイプ: Initial release |
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改定 1.1 | 2011年7月13日 | Group: Version format compliance |
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改定 1.2 | 2012年5月30日 | Group: Database references |
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改定 1.3 | 2020年2月5日 | Group: Data collection / Database references / Other カテゴリ: pdbx_database_status / pdbx_nmr_software ...pdbx_database_status / pdbx_nmr_software / pdbx_nmr_spectrometer / struct_ref_seq_dif Item: _pdbx_database_status.status_code_cs / _pdbx_nmr_software.name ..._pdbx_database_status.status_code_cs / _pdbx_nmr_software.name / _pdbx_nmr_spectrometer.model / _struct_ref_seq_dif.details |
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改定 1.4 | 2024年5月1日 | Group: Data collection / Database references / カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession |
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