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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 2kf0 | ||||||||||||||||||
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タイトル | NMR structure of U6 ISL at pH 7.0 | ||||||||||||||||||
![]() | RNA (5'-R(*![]() RNA / U6 RNA / stem loop / bulge / internal loop | 機能・相同性 | RNA / RNA (> 10) | ![]() 手法 | 溶液NMR / molecular dynamics | ![]() Venditti, V. / Butcher, S.E. | ![]() ![]() タイトル: Minimum-energy path for a u6 RNA conformational change involving protonation, base-pair rearrangement and base flipping. 著者: Venditti, V. / Clos, L. / Niccolai, N. / Butcher, S.E. #1: ![]() タイトル: Structure of the U6 RNA intramolecular stem-loop harboring an S(P)-phosphorothioate modification. 著者: Reiter, N.J. / Nikstad, L.J. / Allmann, A.M. / Johnson, R.J. / Butcher, S.E. #2: ![]() タイトル: Dynamics in the U6 RNA intramolecular stem-loop: a base flipping conformational change. 著者: Reiter, N.J. / Blad, H. / Abildgaard, F. / Butcher, S.E. 履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 151 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 126.2 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
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-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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NMR アンサンブル |
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要素
#1: RNA鎖 | 分子量: 7668.615 Da / 分子数: 1 / 変異: A62G / 由来タイプ: 合成 |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: 溶液NMR | ||||||||||||||||
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NMR実験 |
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試料調製
詳細 |
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試料 |
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試料状態 |
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-NMR測定
NMRスペクトロメーター |
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解析
NMR software |
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精密化 | 手法: molecular dynamics / ソフトェア番号: 1 | ||||||||||||||||
代表構造 | 選択基準: closest to the average | ||||||||||||||||
NMRアンサンブル | コンフォーマー選択の基準: structures with the lowest energy 計算したコンフォーマーの数: 12 / 登録したコンフォーマーの数: 10 |