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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 2k3n | ||||||
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タイトル | Solution structure of the type 1 repetitive domain (TUSP1-RP1) of the egg case silk from Nephila Antipodiana | ||||||
![]() | TuSp1 | ||||||
![]() | STRUCTURAL PROTEIN / HELIX | ||||||
機能・相同性 | ![]() | ||||||
生物種 | ![]() | ||||||
手法 | 溶液NMR / torsion angle dynamics | ||||||
![]() | Lin, Z. / Huang, W. / Fan, J. / Yang, D. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: Solution structure of eggcase silk protein and its implications for silk fiber formation 著者: Lin, Z. / Huang, W. / Zhang, J. / Fan, J.S. / Yang, D. #1: ![]() タイトル: Resonance Assignments of a Repeated Domain of the Egg Case Silk from Nephila Antipodiana 著者: Lin, Z. / Huang, W. / Yang, D. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 381.3 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 318.6 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 356.1 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 420.1 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 27.6 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 39.8 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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NMR アンサンブル |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 15005.036 Da / 分子数: 1 / 断片: A REPEATED DOMAIN, RP1 (UNP residues 1-160) / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) ![]() ![]() ![]() |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: 溶液NMR | ||||||||||||
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NMR実験 |
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NMR実験の詳細 | Text: THE STRUCTURE WAS DETERMINED USING TRIPLE-RESONANCE NMR SPECTROSCOPY |
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試料調製
詳細 | 内容: 1 mM [U-99% 13C; U-99% 15N] TUSP1, 90% H2O/10% D2O / 溶媒系: 90% H2O/10% D2O |
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試料 | 濃度: 1 mM / 構成要素: TUSP1 / Isotopic labeling: [U-99% 13C; U-99% 15N] |
試料状態 | イオン強度: 150mM NaCl / pH: 6.5 / 圧: 1 atm / 温度: 290 K |
-NMR測定
NMRスペクトロメーター | タイプ: BRUKER AVANCE / 製造業者: Bruker / モデル: AVANCE / 磁場強度: 800 MHz |
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解析
NMR software |
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精密化 | 手法: torsion angle dynamics / ソフトェア番号: 1 | ||||||||||||||||||||
代表構造 | 選択基準: lowest energy | ||||||||||||||||||||
NMRアンサンブル | コンフォーマー選択の基準: structures with the lowest energy 計算したコンフォーマーの数: 100 / 登録したコンフォーマーの数: 10 |