手法: 溶液NMR / 詳細: microneme protein complex from T. gondii
NMR実験
Conditions-ID
Experiment-ID
Solution-ID
タイプ
1
1
1
3D 1H-15N NOESY
1
2
2
3D 1H-15N NOESY
1
3
1
3D 1H-13C NOESY
1
4
2
3D 1H-13C NOESY
1
5
1
(12C, 14N)H-NOESY-13C-HSQC
1
6
2
(12C, 14N)H-NOESY-13C-HSQC
-
試料調製
詳細
Solution-ID
内容
溶媒系
1
0.5 mM [U-13C; U-15N] MIC1, 0.5 mM MIC6, 90% H2O/10% D2O
90% H2O/10% D2O
2
0.5 mM [U-13C; U-15N] MIC6, 0.5 mM MIC1, 90% H2O/10% D2O
90% H2O/10% D2O
試料
濃度 (mg/ml)
構成要素
Isotopic labeling
Solution-ID
0.5mM
MIC1
[U-13C; U-15N]
1
0.5mM
MIC6
1
0.5mM
MIC6
[U-13C; U-15N]
2
0.5mM
MIC1
2
試料状態
イオン強度: 0.075 / pH: 6.8 / 圧: ambient / 温度: 303 K
-
NMR測定
NMRスペクトロメーター
タイプ
製造業者
モデル
磁場強度 (MHz)
Spectrometer-ID
Bruker DRX
Bruker
DRX
500
1
Bruker DRX
Bruker
DRX
800
2
-
解析
NMR software
名称
バージョン
開発者
分類
ARIA
2.1
Linge, O'DonoghueandNilges
構造決定
CNS
精密化
精密化
手法: simulated annealing / ソフトェア番号: 1
NMR constraints
NOE constraints total: 4760 / NOE intraresidue total count: 1035 / NOE long range total count: 989 / NOE medium range total count: 269 / NOE sequential total count: 618
代表構造
選択基準: lowest energy
NMRアンサンブル
コンフォーマー選択の基準: structures with the lowest energy 計算したコンフォーマーの数: 40 / 登録したコンフォーマーの数: 1 / Maximum lower distance constraint violation: 0.5 Å / Maximum upper distance constraint violation: 0.5 Å
NMR ensemble rms
Distance rms dev: 0.017 Å / Distance rms dev error: 0.002 Å