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-基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 2jqd | ||||||
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タイトル | Structure of the Leucine-Rich Repeat domain of LANP | ||||||
要素 | Acidic leucine-rich nuclear phosphoprotein 32 family member A | ||||||
キーワード | GENE REGULATION / PROTEIN BINDING / LANP/Anp32a / LRR domain / phosphoprotein / PP2A inhibitor / tumor suppression / transcriptional regulation / RNA shuttling / apoptosis / cerebellar morphogenesis | ||||||
機能・相同性 | 機能・相同性情報 HuR (ELAVL1) binds and stabilizes mRNA / nucleocytoplasmic transport / nuclear matrix / histone binding / regulation of apoptotic process / perinuclear region of cytoplasm / endoplasmic reticulum / nucleus / cytoplasm 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | Mus musculus (ハツカネズミ) | ||||||
手法 | 溶液NMR / simulated annealing | ||||||
Model details | The Leucine-Rich Repeat domain (LRR) of Leucine rich Acidic Nuclear Protein (LANP/Anp32a) | ||||||
データ登録者 | de Chiara, C. / Pastore, A. | ||||||
引用 | ジャーナル: Febs J. / 年: 2008 タイトル: Structural bases for recognition of Anp32/LANP proteins 著者: de Chiara, C. / Menon, R.P. / Pastore, A. #1: ジャーナル: Cerebellum / 年: 2005 タイトル: The Anp32 family of proteins containing leucine-rich repeats 著者: Matilla, A. / Radrizzani, M. #2: ジャーナル: J.Biomol.Nmr / 年: 2007 タイトル: NMR assignment of the Leucine-Rich Repeat domain of LANP/Anp32a 著者: de Chiara, C. / Kelly, G. / Frenkiel, T.A. / Pastore, A. | ||||||
履歴 |
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-構造の表示
構造ビューア | 分子: MolmilJmol/JSmol |
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-ダウンロードとリンク
-ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | 2jqd.cif.gz | 521.8 KB | 表示 | PDBx/mmCIF形式 |
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PDB形式 | pdb2jqd.ent.gz | 432.5 KB | 表示 | PDB形式 |
PDBx/mmJSON形式 | 2jqd.json.gz | ツリー表示 | PDBx/mmJSON形式 | |
その他 | その他のダウンロード |
-検証レポート
文書・要旨 | 2jqd_validation.pdf.gz | 340.9 KB | 表示 | wwPDB検証レポート |
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文書・詳細版 | 2jqd_full_validation.pdf.gz | 418.5 KB | 表示 | |
XML形式データ | 2jqd_validation.xml.gz | 34.2 KB | 表示 | |
CIF形式データ | 2jqd_validation.cif.gz | 45.5 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/jq/2jqd ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/jq/2jqd | HTTPS FTP |
-関連構造データ
類似構造データ | |
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その他のデータベース |
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-リンク
-集合体
登録構造単位 |
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NMR アンサンブル |
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-要素
#1: タンパク質 | 分子量: 19213.932 Da / 分子数: 1 / 断片: The N-terminal LRR domain of LANP / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Mus musculus (ハツカネズミ) / 遺伝子: Anp32a, Anp32, Lanp / 生物種 (発現宿主): Escherichia coli / 発現宿主: Escherichia coli BL21(DE3) (大腸菌) / 株 (発現宿主): BL21 / Variant (発現宿主): DE3 / 参照: UniProt: O35381 |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: 溶液NMR 詳細: The Leucine-Rich Repeat domain (LRR) of Leucine rich Acidic Nuclear Protein (LANP/Anp32a) | ||||||||||||||||||||
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NMR実験 |
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-試料調製
詳細 |
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試料 |
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試料状態 | pH: 7 / 圧: ambient / 温度: 300 K |
-NMR測定
NMRスペクトロメーター |
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-解析
NMR software |
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精密化 | 手法: simulated annealing / ソフトェア番号: 1 / 詳細: water refinement | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
代表構造 | 選択基準: regularity of secondary sturctures | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NMRアンサンブル | コンフォーマー選択の基準: structures with the lowest energy 計算したコンフォーマーの数: 100 / 登録したコンフォーマーの数: 10 |