登録情報 データベース : PDB / ID : 2jar 構造の表示 ダウンロードとリンクタイトル Crystal structure of D12N variant of mouse cytosolic 5'(3')- deoxyribonucleotidase (cdN) in complex with deoxyuridine 5'- monophosphate 要素5'(3')-DEOXYRIBONUCLEOTIDASE 詳細 キーワード HYDROLASE / NUCLEOTIDE METABOLISM / NUCLEOTIDE-BINDING / ALFA BETA FOLD / METAL- BINDING / TRANSIT PEPTIDE / CYTOSOLIC / MAGNESIUM / METAL-BINDING機能・相同性 機能・相同性情報分子機能 ドメイン・相同性 構成要素
Purine catabolism / pyrimidine nucleotide binding / Pyrimidine catabolism / dTMP catabolic process / UMP catabolic process / pyrimidine deoxyribonucleotide catabolic process / dCMP catabolic process / dGMP catabolic process / dUMP catabolic process / amide catabolic process ... Purine catabolism / pyrimidine nucleotide binding / Pyrimidine catabolism / dTMP catabolic process / UMP catabolic process / pyrimidine deoxyribonucleotide catabolic process / dCMP catabolic process / dGMP catabolic process / dUMP catabolic process / amide catabolic process / IMP 5'-nucleotidase activity / IMP catabolic process / deoxyribonucleotide catabolic process / allantoin metabolic process / 加水分解酵素; エステル加水分解酵素; 1価のリン酸エステル加水分解酵素 / 5'-nucleotidase activity / dephosphorylation / phosphatase activity / mitochondrion / identical protein binding / nucleus / metal ion binding / cytosol 類似検索 - 分子機能 5'(3')-deoxyribonucleotidase / 5' nucleotidase, deoxy (Pyrimidine), cytosolic type C protein (NT5C) / Deoxyribonucleotidase; domain 2 / Ribonucleotide Reductase Protein R1; domain 1 / HAD superfamily/HAD-like / HAD superfamily / HAD-like superfamily / Rossmann fold / Orthogonal Bundle / 3-Layer(aba) Sandwich ... 5'(3')-deoxyribonucleotidase / 5' nucleotidase, deoxy (Pyrimidine), cytosolic type C protein (NT5C) / Deoxyribonucleotidase; domain 2 / Ribonucleotide Reductase Protein R1; domain 1 / HAD superfamily/HAD-like / HAD superfamily / HAD-like superfamily / Rossmann fold / Orthogonal Bundle / 3-Layer(aba) Sandwich / Mainly Alpha / Alpha Beta 類似検索 - ドメイン・相同性 2'-DEOXYURIDINE 5'-MONOPHOSPHATE / 5'(3')-deoxyribonucleotidase, cytosolic type 類似検索 - 構成要素生物種 MUS MUSCULUS (ハツカネズミ)手法 X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度 : 1.94 Å 詳細データ登録者 Wallden, K. / Ruzzenente, B. / Bianchi, V. / Nordlund, P. 引用ジャーナル : Biochemistry / 年 : 2007タイトル : Crystal Structures of Human and Murine Deoxyribonucleotidases: Insights Into Recognition of Substrates and Nucleotide Analogues.著者 : Wallden, K. / Rinaldo-Matthis, A. / Ruzzenente, B. / Rampazzo, C. / Bianchi, V. / Nordlund, P. 履歴 登録 2006年11月30日 登録サイト : PDBE / 処理サイト : PDBE改定 1.0 2007年11月20日 Provider : repository / タイプ : Initial release改定 1.1 2011年5月8日 Group : Version format compliance改定 1.2 2011年7月13日 Group : Version format compliance改定 1.3 2019年5月15日 Group : Data collection / Experimental preparation / Otherカテゴリ : exptl_crystal_grow / pdbx_database_proc ... exptl_crystal_grow / pdbx_database_proc / pdbx_database_status / struct_biol Item : _exptl_crystal_grow.method / _exptl_crystal_grow.temp / _pdbx_database_status.recvd_author_approval改定 1.4 2024年5月8日 Group : Data collection / Database references ... Data collection / Database references / Derived calculations / Other カテゴリ : chem_comp_atom / chem_comp_bond ... chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_database_status / struct_conn Item : _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ... _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _pdbx_database_status.status_code_sf / _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id / _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id / _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr1_label_asym_id / _struct_conn.ptnr1_label_atom_id / _struct_conn.ptnr1_label_comp_id / _struct_conn.ptnr1_label_seq_id / _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr2_label_asym_id / _struct_conn.ptnr2_label_atom_id / _struct_conn.ptnr2_label_comp_id / _struct_conn.ptnr2_label_seq_id
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