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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 2ius | ||||||
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タイトル | E. coli FtsK motor domain | ||||||
![]() | DNA TRANSLOCASE FTSK | ||||||
![]() | MEMBRANE PROTEIN / NUCLEOTIDE-BINDING / CHROMOSOME PARTITION / ATP-BINDING / DNA-BINDING / CELL DIVISION / TRANSMEMBRANE / INNER MEMBRANE / HEXAMERIC RING / DNA TRANSLOCATION / KOPS / MEMBRANE / DIVISOME / CELL CYCLE / AAA ATPASE | ||||||
機能・相同性 | ![]() double-stranded DNA helicase activity / divisome complex / septum digestion after cytokinesis / DNA translocase activity / FtsZ-dependent cytokinesis / division septum assembly / response to osmotic stress / cellular response to antibiotic / cell division site / response to salt stress ...double-stranded DNA helicase activity / divisome complex / septum digestion after cytokinesis / DNA translocase activity / FtsZ-dependent cytokinesis / division septum assembly / response to osmotic stress / cellular response to antibiotic / cell division site / response to salt stress / chromosome segregation / sequence-specific DNA binding / cell division / positive regulation of DNA-templated transcription / ATP hydrolysis activity / DNA binding / ATP binding / identical protein binding / membrane / plasma membrane 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | ![]() ![]() | ||||||
手法 | ![]() ![]() ![]() | ||||||
![]() | Massey, T.H. / Mercogliano, C.P. / Yates, J. / Sherratt, D.J. / Lowe, J. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: Double-Stranded DNA Translocation: Structure and Mechanism of Hexameric Ftsk 著者: Massey, T.H. / Mercogliano, C.P. / Yates, J. / Sherratt, D.J. / Lowe, J. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 460.8 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 377.6 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 510.1 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 616.8 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 97.2 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 131.4 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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単位格子 |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 56266.695 Da / 分子数: 6 / 断片: MOTOR DOMAIN, RESIDUES 818-1329 / 変異: YES / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) ![]() ![]() ![]() ![]() #2: 水 | ChemComp-HOH / | 構成要素の詳細 | ENGINEERED RESIDUE IN CHAIN A, LYS 997 TO ALA ENGINEERED RESIDUE IN CHAIN B, LYS 997 TO ALA ...ENGINEERED | |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.49 Å3/Da / 溶媒含有率: 51 % |
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-データ収集
回折 | 平均測定温度: 100 K |
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放射光源 | 由来: ![]() ![]() ![]() |
検出器 | タイプ: ADSC CCD / 検出器: CCD |
放射 | プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray |
放射波長 | 波長: 0.979 Å / 相対比: 1 |
反射 | 解像度: 2.7→100 Å / Num. obs: 80156 / % possible obs: 99.8 % / Observed criterion σ(I): 0 / 冗長度: 3.7 % / Biso Wilson estimate: 58 Å2 / Rmerge(I) obs: 0.1 / Net I/σ(I): 11.3 |
反射 シェル | 解像度: 2.7→2.85 Å / 冗長度: 3.8 % / Rmerge(I) obs: 0.29 / Mean I/σ(I) obs: 3.9 / % possible all: 99.8 |
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解析
ソフトウェア |
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精密化 | 構造決定の手法: ![]()
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溶媒の処理 | Bsol: 47.0167 Å2 / ksol: 0.350993 e/Å3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
原子変位パラメータ | Biso mean: 48 Å2
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精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 2.7→100 Å
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拘束条件 |
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LS精密化 シェル | 解像度: 2.7→2.72 Å / Rfactor Rfree: 0.3746 / Rfactor Rwork: 0.3097 / Total num. of bins used: 50 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Xplor file |
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