+
データを開く
-
基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 2igz | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
タイトル | NMR structure of the sterol-dependent antifungal antibiotic bacillomycin Lc | ||||||
![]() | BACILLOMYCIN L-3 | ||||||
![]() | ANTIBIOTIC / ITURINS / ANTIFUNGAL / CYCLOPEPTIDE / LIPOPEPTIDE / SURFACTANT BACILLOMYCIN | ||||||
機能・相同性 | Bacillomycin Lc / : ![]() | ||||||
生物種 | ![]() ![]() | ||||||
手法 | 溶液NMR / DISTANCE GEOMETRY SIMULATED ANNEALING | ||||||
![]() | Volpon, L. / Tsan, P. / Besson, F. / Lancelin, J.M. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: NMR Structure Determination of a Synthetic Analogue of Bacillomycin Lc Reveals the Strategic Role of L-Asn1 in the Natural Iturinic Antibiotics. 著者: Volpon, L. / Tsan, P. / Majer, Z. / Vass, E. / Hollosi, M. / Noguera, V. / Lancelin, J.M. / Besson, F. #1: ジャーナル: Eur.J.Biochem. / 年: 1999 タイトル: NMR Structure of Active and Inactive Forms of the Sterol-Dependent Antifungal Antibiotic Bacillomycin L 著者: Volpon, L. / Besson, F. / Lancelin, J.M. | ||||||
履歴 |
|
-
構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
---|
-
ダウンロードとリンク
-
ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 53.8 KB | 表示 | ![]() |
---|---|---|---|---|
PDB形式 | ![]() | 40.3 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 349.9 KB | 表示 | ![]() |
---|---|---|---|---|
文書・詳細版 | ![]() | 396.2 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 6.3 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 8.1 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
関連構造データ | ![]() 2ih0C C: 同じ文献を引用 ( |
---|---|
類似構造データ | |
その他のデータベース |
|
-
リンク
-
集合体
登録構造単位 | ![]()
| |||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
1 |
| |||||||||
NMR アンサンブル |
|
-
要素
-実験情報
-実験
実験 | 手法: 溶液NMR | ||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NMR実験 |
| ||||||||||||||||||||||||
NMR実験の詳細 | Text: THIS STRUCTURE WAS DETERMINED USING STANDARD 2D HOMONUCLEAR TECHNIQUES |
-
試料調製
詳細 | 内容: 3MM BACILLOMYCIN LC IN 100% DMSO-D6 |
---|---|
試料状態 | 圧: AMBIENT / 温度: 292 K |
-NMR測定
放射 | プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray |
---|---|
放射波長 | 相対比: 1 |
NMRスペクトロメーター | タイプ: Bruker DRX / 製造業者: Bruker / モデル: DRX / 磁場強度: 500 MHz |
-
解析
NMR software |
| ||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
精密化 | 手法: DISTANCE GEOMETRY SIMULATED ANNEALING / ソフトェア番号: 1 詳細: THE STRUCTURES ARE BASED ON A TOTAL OF 74 RESTRAINTS, 71 ARE NOE-DERIVED DISTANCE CONSTRAINTS, 3 DIHEDRAL ANGLE RESTRAINTS. THE 19 STRUCTURES WERE DIVIDED INTO TWO FAMILIES OF SIMILAR ENERGY ...詳細: THE STRUCTURES ARE BASED ON A TOTAL OF 74 RESTRAINTS, 71 ARE NOE-DERIVED DISTANCE CONSTRAINTS, 3 DIHEDRAL ANGLE RESTRAINTS. THE 19 STRUCTURES WERE DIVIDED INTO TWO FAMILIES OF SIMILAR ENERGY WHICH ESSENTIALLY DIFFER IN THE NUMBER AND TYPE OF TURNS. THE TWO FAMILIES ARE S1 (STRUCTURES 1-12) AND S2 (STRUCTURES 13-19). | ||||||||||||||||||
NMRアンサンブル | コンフォーマー選択の基準: STRUCTURES WITH THE LEAST RESTRAINT VIOLATIONS, STRUCTURES WITH THE LOWEST ENERGY 計算したコンフォーマーの数: 50 / 登録したコンフォーマーの数: 19 |