登録情報 | データベース: PDB / ID: 2ifr |
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タイトル | Crystal structure of Scytalido-glutamic peptidase with a peptide based transition state analog |
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要素 | - Octapeptide
- Scytalidopepsin B
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キーワード | HYDROLASE/HYDROLASE INHIBITOR / enzyme-transition state analog complex / HYDROLASE-HYDROLASE INHIBITOR complex |
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機能・相同性 | 機能・相同性情報
scytalidopepsin B / glutamic-type endopeptidase activity / aspartic-type endopeptidase activity / proteolysis類似検索 - 分子機能 Scytalidoglutamic peptidase / Peptidase G1 / Peptidase G1 / Peptidase G1 superfamily / Peptidase A4 family / Concanavalin A-like lectin/glucanase domain superfamily / Jelly Rolls / Sandwich / Mainly Beta類似検索 - ドメイン・相同性 |
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生物種 | Scytalidium lignicola (菌類) |
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手法 | X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度: 1.95 Å |
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データ登録者 | Pillai, B. / Cherney, M.M. / Hiraga, K. / Takada, K. / Oda, K. / James, M.N. |
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引用 | ジャーナル: J.Mol.Biol. / 年: 2007 タイトル: Crystal structure of scytalidoglutamic peptidase with its first potent inhibitor provides insights into substrate specificity and catalysis. 著者: Pillai, B. / Cherney, M.M. / Hiraga, K. / Takada, K. / Oda, K. / James, M.N. |
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履歴 | 登録 | 2006年9月21日 | 登録サイト: RCSB / 処理サイト: RCSB |
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改定 1.0 | 2006年10月3日 | Provider: repository / タイプ: Initial release |
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改定 1.1 | 2008年5月1日 | Group: Version format compliance |
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改定 1.2 | 2011年7月13日 | Group: Atomic model / Database references ...Atomic model / Database references / Derived calculations / Non-polymer description / Structure summary / Version format compliance |
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改定 1.3 | 2023年8月30日 | Group: Data collection / Database references ...Data collection / Database references / Derived calculations / Refinement description カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model / struct_conn / struct_site Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ..._database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _struct_conn.pdbx_dist_value / _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag / _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr1_label_comp_id / _struct_conn.ptnr1_label_seq_id / _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr2_label_comp_id / _struct_conn.ptnr2_label_seq_id / _struct_site.pdbx_auth_asym_id / _struct_site.pdbx_auth_comp_id / _struct_site.pdbx_auth_seq_id |
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改定 1.4 | 2023年11月15日 | Group: Data collection / Derived calculations / カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond / struct_conn Item: _chem_comp_atom.atom_id / _chem_comp_bond.atom_id_2 / _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag |
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改定 2.0 | 2024年7月10日 | Group: Data collection / Derived calculations ...Data collection / Derived calculations / Non-polymer description / Structure summary カテゴリ: chem_comp / chem_comp_atom ...chem_comp / chem_comp_atom / chem_comp_bond / entity / struct_conn Item: _chem_comp.formula / _chem_comp.formula_weight ..._chem_comp.formula / _chem_comp.formula_weight / _entity.formula_weight / _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag |
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