登録情報 | データベース: PDB / ID: 2idb |
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タイトル | Crystal Structure of 3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase (UbiD) from Escherichia coli, Northeast Structural Genomics Target ER459. |
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要素 | 3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase |
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キーワード | LYASE / alpha-beta protein / Structural Genomics / PSI-2 / Protein Structure Initiative / Northeast Structural Genomics Consortium / NESG |
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機能・相同性 | 機能・相同性情報
prenyl-FMNH2 binding / 4-hydroxy-3-polyprenylbenzoate decarboxylase / : / 4-hydroxy-3-polyprenylbenzoate decarboxylase activity / ubiquinone biosynthetic process / protein hexamerization / manganese ion binding / identical protein binding / plasma membrane / cytosol / cytoplasm類似検索 - 分子機能 Single helix bin / UbiD decarboxylyase, bacteria / UbiD C-terminal domain-like / UbiD C-terminal domain-like / : / : / : / 3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase N-terminal domain / 3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase C-terminal domain / UbiD decarboxylyase family ...Single helix bin / UbiD decarboxylyase, bacteria / UbiD C-terminal domain-like / UbiD C-terminal domain-like / : / : / : / 3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase N-terminal domain / 3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase C-terminal domain / UbiD decarboxylyase family / 3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase Rift-related domain / Single alpha-helices involved in coiled-coils or other helix-helix interfaces / Up-down Bundle / 3-Layer(aba) Sandwich / Mainly Alpha / Alpha Beta類似検索 - ドメイン・相同性 3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase類似検索 - 構成要素 |
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生物種 |  Escherichia coli (大腸菌) |
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手法 | X線回折 / シンクロトロン / 単波長異常分散 / 解像度: 2.9 Å |
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データ登録者 | Zhou, W. / Forouhar, F. / Seetharaman, J. / Fang, Y. / Xiao, R. / Cunningham, K. / Ma, L.-C. / Chen, C.X. / Acton, T.B. / Montelione, G.T. ...Zhou, W. / Forouhar, F. / Seetharaman, J. / Fang, Y. / Xiao, R. / Cunningham, K. / Ma, L.-C. / Chen, C.X. / Acton, T.B. / Montelione, G.T. / Hunt, J.F. / Tong, L. / Northeast Structural Genomics Consortium (NESG) |
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引用 | ジャーナル: TO BE PUBLISHED タイトル: Crystal Structure of 3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase (UbiD) from Escherichia coli, Northeast Structural Genomics Target ER459. 著者: Zhou, W. / Forouhar, F. / Seetharaman, J. / Fang, Y. / Xiao, R. / Cunningham, K. / Ma, L.-C. / Chen, C.X. / Acton, T.B. / Montelione, G.T. / Hunt, J.F. / Tong, L. / Northeast Structural Genomics Consortium (NESG) |
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履歴 | 登録 | 2006年9月14日 | 登録サイト: RCSB / 処理サイト: RCSB |
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改定 1.0 | 2006年10月24日 | Provider: repository / タイプ: Initial release |
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改定 1.1 | 2007年10月16日 | Group: Version format compliance |
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改定 1.2 | 2011年7月13日 | Group: Derived calculations / Source and taxonomy / Version format compliance |
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改定 1.3 | 2017年10月18日 | Group: Database references / Refinement description / Structure summary カテゴリ: audit_author / citation_author / software Item: _audit_author.name / _citation_author.name / _software.name |
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改定 1.4 | 2024年10月30日 | Group: Data collection / Database references ...Data collection / Database references / Derived calculations / Structure summary カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_entry_details / pdbx_modification_feature / struct_conn / struct_ref_seq_dif / struct_site Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ..._database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag / _struct_ref_seq_dif.details / _struct_site.pdbx_auth_asym_id / _struct_site.pdbx_auth_comp_id / _struct_site.pdbx_auth_seq_id |
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