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-基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 2hua | ||||||
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タイトル | Solution Structure of CSFV IRES Domain IIa | ||||||
要素 | CSFV IRES Domain IIa | ||||||
キーワード | RNA / RNA HAIRPIN | ||||||
機能・相同性 | RNA / RNA (> 10) 機能・相同性情報 | ||||||
手法 | 溶液NMR | ||||||
データ登録者 | Locker, N. / Easton, L.E. / Lukavsky, P.J. | ||||||
引用 | ジャーナル: Embo J. / 年: 2007 タイトル: HCV and CSFV IRES domain II mediate eIF2 release during 80S ribosome assembly. 著者: Locker, N. / Easton, L.E. / Lukavsky, P.J. | ||||||
履歴 |
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-構造の表示
構造ビューア | 分子: MolmilJmol/JSmol |
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-ダウンロードとリンク
-ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | 2hua.cif.gz | 269.8 KB | 表示 | PDBx/mmCIF形式 |
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PDB形式 | pdb2hua.ent.gz | 228 KB | 表示 | PDB形式 |
PDBx/mmJSON形式 | 2hua.json.gz | ツリー表示 | PDBx/mmJSON形式 | |
その他 | その他のダウンロード |
-検証レポート
文書・要旨 | 2hua_validation.pdf.gz | 321.1 KB | 表示 | wwPDB検証レポート |
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文書・詳細版 | 2hua_full_validation.pdf.gz | 391.5 KB | 表示 | |
XML形式データ | 2hua_validation.xml.gz | 8.7 KB | 表示 | |
CIF形式データ | 2hua_validation.cif.gz | 15.1 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/hu/2hua ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/hu/2hua | HTTPS FTP |
-関連構造データ
-リンク
-集合体
登録構造単位 |
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1 |
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NMR アンサンブル |
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-要素
#1: RNA鎖 | 分子量: 12918.777 Da / 分子数: 1 / 断片: residues 70-84 and 111-127 / 由来タイプ: 合成 詳細: Prepared by in vitro transcription using T7 RNA polymerase |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: 溶液NMR | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NMR実験 |
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NMR実験の詳細 | Text: The structure was solved using triple resonance, multidimensional NMR spectroscopy and TROSY-type experiments to measure residual dipolar couplings |
-試料調製
詳細 |
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試料状態 |
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-NMR測定
放射 | プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M | |||||||||||||||
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放射波長 | 相対比: 1 | |||||||||||||||
NMRスペクトロメーター |
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-解析
NMR software |
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代表構造 | 選択基準: lowest energy | ||||||||||||||||||||
NMRアンサンブル | コンフォーマー選択の基準: lowest restraint violation and total energy 計算したコンフォーマーの数: 100 / 登録したコンフォーマーの数: 11 |