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-基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 2hts | ||||||
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タイトル | CRYSTAL STRUCTURE OF THE DNA BINDING DOMAIN OF THE HEAT SHOCK TRANSCRIPTION FACTOR | ||||||
要素 | HEAT-SHOCK TRANSCRIPTION FACTOR | ||||||
キーワード | TRANSCRIPTION FACTOR | ||||||
機能・相同性 | 機能・相同性情報 protein-DNA complex / cellular response to heat / RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding / DNA-binding transcription factor activity / regulation of transcription by RNA polymerase II / DNA binding / nucleus 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | Kluyveromyces lactis (酵母) | ||||||
手法 | X線回折 / 解像度: 1.83 Å | ||||||
データ登録者 | Harrison, C. / Nelson, H. | ||||||
引用 | ジャーナル: Science / 年: 1994 タイトル: Crystal structure of the DNA binding domain of the heat shock transcription factor. 著者: Harrison, C.J. / Bohm, A.A. / Nelson, H.C. | ||||||
履歴 |
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-構造の表示
構造ビューア | 分子: MolmilJmol/JSmol |
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-ダウンロードとリンク
-ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | 2hts.cif.gz | 30.7 KB | 表示 | PDBx/mmCIF形式 |
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PDB形式 | pdb2hts.ent.gz | 20.7 KB | 表示 | PDB形式 |
PDBx/mmJSON形式 | 2hts.json.gz | ツリー表示 | PDBx/mmJSON形式 | |
その他 | その他のダウンロード |
-検証レポート
文書・要旨 | 2hts_validation.pdf.gz | 375.4 KB | 表示 | wwPDB検証レポート |
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文書・詳細版 | 2hts_full_validation.pdf.gz | 376.4 KB | 表示 | |
XML形式データ | 2hts_validation.xml.gz | 3.4 KB | 表示 | |
CIF形式データ | 2hts_validation.cif.gz | 4.9 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/ht/2hts ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/ht/2hts | HTTPS FTP |
-関連構造データ
-リンク
-集合体
登録構造単位 |
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1 |
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単位格子 |
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-要素
#1: タンパク質 | 分子量: 10950.279 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Kluyveromyces lactis (酵母) / 参照: UniProt: P22121 | ||
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#2: 化合物 | #3: 水 | ChemComp-HOH / | |
-実験情報
-実験
実験 | 手法: X線回折 |
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-試料調製
結晶 | マシュー密度: 1.93 Å3/Da / 溶媒含有率: 36.28 % | ||||||||||||||||||||||||||||||
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結晶化 | *PLUS 温度: 8 ℃ / 手法: 蒸気拡散法 | ||||||||||||||||||||||||||||||
溶液の組成 | *PLUS
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-解析
ソフトウェア |
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精密化 | 解像度: 1.83→8 Å / σ(F): 0 /
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精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 1.83→8 Å
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拘束条件 |
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ソフトウェア | *PLUS 名称: X-PLOR / 分類: refinement | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
精密化 | *PLUS Rfactor obs: 0.187 / Rfactor Rfree: 0.248 / Rfactor Rwork: 0.187 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
溶媒の処理 | *PLUS | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
原子変位パラメータ | *PLUS | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
拘束条件 | *PLUS タイプ: x_angle_d / Dev ideal: 1.45 |