登録情報 | データベース: PDB / ID: 2gn8 |
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タイトル | Crystal structure of UDP-GlcNAc inverting 4,6-dehydratase in complex with NADP and UDP |
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要素 | UDP-GlcNAc C6 dehydratase |
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キーワード | LYASE / Rossmann fold / TYK triad / SDR / enzyme / dehydratase / UDP-GlcNAc / NADP |
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機能・相同性 | 機能・相同性情報
UDP-N-acetylglucosamine 4,6-dehydratase (configuration-inverting) / lyase activity / nucleotide binding類似検索 - 分子機能 UDP-N-acetylglucosamine 4,6-dehydratase (inverting) / Polysaccharide biosynthesis protein, CapD-like domain / : / Polysaccharide biosynthesis protein, CapD-like domain / Polysaccharide biosynthesis protein / UDP-galactose 4-epimerase; domain 1 / NAD(P)-binding Rossmann-like Domain / NAD(P)-binding domain superfamily / Alpha-Beta Complex / Rossmann fold ...UDP-N-acetylglucosamine 4,6-dehydratase (inverting) / Polysaccharide biosynthesis protein, CapD-like domain / : / Polysaccharide biosynthesis protein, CapD-like domain / Polysaccharide biosynthesis protein / UDP-galactose 4-epimerase; domain 1 / NAD(P)-binding Rossmann-like Domain / NAD(P)-binding domain superfamily / Alpha-Beta Complex / Rossmann fold / 3-Layer(aba) Sandwich / Alpha Beta類似検索 - ドメイン・相同性 NADP NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE PHOSPHATE / URIDINE-5'-DIPHOSPHATE / UDP-N-acetylglucosamine 4,6-dehydratase (inverting)類似検索 - 構成要素 |
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生物種 | Helicobacter pylori (ピロリ菌) |
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手法 | X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度: 2.1 Å |
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データ登録者 | Ishiyama, N. / Creuzenet, C. / Lam, J.S. / Berghuis, A.M. |
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引用 | ジャーナル: J.Biol.Chem. / 年: 2006 タイトル: Structural Studies of FlaA1 from Helicobacter pylori Reveal the Mechanism for Inverting 4,6-Dehydratase Activity. 著者: Ishiyama, N. / Creuzenet, C. / Miller, W.L. / Demendi, M. / Anderson, E.M. / Harauz, G. / Lam, J.S. / Berghuis, A.M. |
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履歴 | 登録 | 2006年4月9日 | 登録サイト: RCSB / 処理サイト: RCSB |
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改定 1.0 | 2006年5月9日 | Provider: repository / タイプ: Initial release |
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改定 1.1 | 2008年5月1日 | Group: Version format compliance |
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改定 1.2 | 2011年7月13日 | Group: Derived calculations / Version format compliance |
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改定 1.3 | 2017年10月18日 | Group: Refinement description / カテゴリ: software |
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改定 1.4 | 2023年8月30日 | Group: Data collection / Database references ...Data collection / Database references / Derived calculations / Refinement description カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model / struct_ref_seq_dif / struct_site Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ..._database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _struct_ref_seq_dif.details / _struct_site.pdbx_auth_asym_id / _struct_site.pdbx_auth_comp_id / _struct_site.pdbx_auth_seq_id |
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