登録情報 | データベース: PDB / ID: 2fli |
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タイトル | The crystal structure of D-ribulose 5-phosphate 3-epimerase from Streptococus pyogenes complexed with D-xylitol 5-phosphate |
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要素 | ribulose-phosphate 3-epimerase |
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キーワード | ISOMERASE / D-ribulose 5-phosphate 3-epimerase / (beta/alpha)8-barrel / D-xylitol 5-phosphate |
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機能・相同性 | 機能・相同性情報
ribulose-phosphate 3-epimerase / D-ribulose-phosphate 3-epimerase activity / pentose catabolic process / pentose-phosphate shunt / metal ion binding類似検索 - 分子機能 Ribulose-phosphate 3-epimerase / Ribulose-phosphate 3-epimerase family signature 2. / Ribulose-phosphate 3-epimerase family signature 1. / Ribulose-phosphate 3-epimerase-like / Ribulose-phosphate 3 epimerase family / Ribulose-phosphate binding barrel / Aldolase class I / Aldolase-type TIM barrel / TIM Barrel / Alpha-Beta Barrel / Alpha Beta類似検索 - ドメイン・相同性 D-XYLITOL-5-PHOSPHATE / Ribulose-phosphate 3-epimerase類似検索 - 構成要素 |
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生物種 | Streptococcus pyogenes (化膿レンサ球菌) |
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手法 | X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度: 1.8 Å |
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データ登録者 | Fedorov, A.A. / Fedorov, E.V. / Akana, J. / Gerlt, J.A. / Almo, S.C. |
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引用 | ジャーナル: Biochemistry / 年: 2006 タイトル: d-Ribulose 5-Phosphate 3-Epimerase: Functional and Structural Relationships to Members of the Ribulose-Phosphate Binding (beta/alpha)(8)-Barrel Superfamily(,). 著者: Akana, J. / Fedorov, A.A. / Fedorov, E. / Novak, W.R. / Babbitt, P.C. / Almo, S.C. / Gerlt, J.A. |
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履歴 | 登録 | 2006年1月6日 | 登録サイト: RCSB / 処理サイト: RCSB |
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改定 1.0 | 2006年3月7日 | Provider: repository / タイプ: Initial release |
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改定 1.1 | 2008年5月1日 | Group: Version format compliance |
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改定 1.2 | 2011年7月13日 | Group: Version format compliance |
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改定 1.3 | 2023年8月30日 | Group: Data collection / Database references ...Data collection / Database references / Derived calculations / Refinement description カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model / pdbx_struct_conn_angle / struct_conn / struct_site Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ..._database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_atom_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_atom_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.value / _struct_conn.pdbx_dist_value / _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr1_label_asym_id / _struct_conn.ptnr1_label_atom_id / _struct_conn.ptnr1_label_comp_id / _struct_conn.ptnr1_label_seq_id / _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr2_label_asym_id / _struct_conn.ptnr2_label_atom_id / _struct_conn.ptnr2_label_comp_id / _struct_conn.ptnr2_label_seq_id / _struct_site.pdbx_auth_asym_id / _struct_site.pdbx_auth_comp_id / _struct_site.pdbx_auth_seq_id |
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