登録情報 | データベース: PDB / ID: 2e5w |
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タイトル | Crystal structure of spermidine synthase from Pyrococcus horikoshii OT3 |
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要素 | Probable spermidine synthase |
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キーワード | TRANSFERASE / spermidine synthase / Structural Genomics / NPPSFA / National Project on Protein Structural and Functional Analyses / RIKEN Structural Genomics/Proteomics Initiative / RSGI |
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機能・相同性 | 機能・相同性情報
spermidine synthase / spermidine synthase activity / spermidine biosynthetic process / cytoplasm類似検索 - 分子機能 Spermidine synthase, tetramerisation domain / Polyamine biosynthesis domain, conserved site / Polyamine biosynthesis (PABS) domain signature. / Spermidine/spermine synthases / Polyamine biosynthesis domain / Spermidine synthase, tetramerisation domain / Spermidine synthase, tetramerisation domain superfamily / Spermidine synthase tetramerisation domain / Polyamine biosynthesis (PABS) domain profile. / Spermine/spermidine synthase domain ...Spermidine synthase, tetramerisation domain / Polyamine biosynthesis domain, conserved site / Polyamine biosynthesis (PABS) domain signature. / Spermidine/spermine synthases / Polyamine biosynthesis domain / Spermidine synthase, tetramerisation domain / Spermidine synthase, tetramerisation domain superfamily / Spermidine synthase tetramerisation domain / Polyamine biosynthesis (PABS) domain profile. / Spermine/spermidine synthase domain / Spermidine Synthase; Chain: A, domain 2 / Vaccinia Virus protein VP39 / Roll / S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase superfamily / Rossmann fold / 3-Layer(aba) Sandwich / Mainly Beta / Alpha Beta類似検索 - ドメイン・相同性 ACETATE ION / 1-{4-[(3-aminopropyl)amino]butyl}guanidine / 5'-DEOXY-5'-METHYLTHIOADENOSINE / Polyamine aminopropyltransferase類似検索 - 構成要素 |
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生物種 | ![](img/tx_archaea.gif) Pyrococcus horikoshii (古細菌) |
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手法 | X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度: 2 Å |
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データ登録者 | Mizutani, H. / Kunishima, N. / RIKEN Structural Genomics/Proteomics Initiative (RSGI) |
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引用 | ジャーナル: To be Published タイトル: Crystal structure of spermidine synthase from Pyrococcus horikoshii OT3 著者: Mizutani, H. / Kunishima, N. |
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履歴 | 登録 | 2006年12月25日 | 登録サイト: PDBJ / 処理サイト: PDBJ |
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改定 1.0 | 2007年6月26日 | Provider: repository / タイプ: Initial release |
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改定 1.1 | 2008年4月30日 | Group: Version format compliance |
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改定 1.2 | 2011年7月13日 | Group: Source and taxonomy / Version format compliance |
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改定 1.3 | 2023年10月25日 | Group: Data collection / Database references ...Data collection / Database references / Derived calculations / Refinement description カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model / struct_site Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ..._database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _struct_site.pdbx_auth_asym_id / _struct_site.pdbx_auth_comp_id / _struct_site.pdbx_auth_seq_id |
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