登録情報 | データベース: PDB / ID: 2dxf |
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タイトル | Crystal structure of nucleoside diphosphate kinase in complex with GTP analog |
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要素 | Nucleoside diphosphate kinase |
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キーワード | TRANSFERASE / nucleoside binding / kinase / Structural Genomics / NPPSFA / National Project on Protein Structural and Functional Analyses / RIKEN Structural Genomics/Proteomics Initiative / RSGI |
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機能・相同性 | 機能・相同性情報
nucleoside-diphosphate kinase / UTP biosynthetic process / CTP biosynthetic process / GTP biosynthetic process / nucleoside diphosphate kinase activity / ATP binding / metal ion binding / cytoplasm類似検索 - 分子機能 Nucleoside diphosphate kinase (NDPK)-like domain profile. / Nucleoside diphosphate kinase-like domain / Nucleoside diphosphate kinase, active site / Nucleoside diphosphate kinase (NDPK) active site signature. / Nucleoside diphosphate kinase / Nucleoside diphosphate kinase-like domain / Nucleoside diphosphate kinase / NDK / Nucleoside diphosphate kinase-like domain superfamily / Alpha-Beta Plaits ...Nucleoside diphosphate kinase (NDPK)-like domain profile. / Nucleoside diphosphate kinase-like domain / Nucleoside diphosphate kinase, active site / Nucleoside diphosphate kinase (NDPK) active site signature. / Nucleoside diphosphate kinase / Nucleoside diphosphate kinase-like domain / Nucleoside diphosphate kinase / NDK / Nucleoside diphosphate kinase-like domain superfamily / Alpha-Beta Plaits / 2-Layer Sandwich / Alpha Beta類似検索 - ドメイン・相同性 PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER / Nucleoside diphosphate kinase類似検索 - 構成要素 |
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生物種 | Pyrococcus horikoshii (古細菌) |
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手法 | X線回折 / 分子置換 / 解像度: 1.7 Å |
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データ登録者 | Kato-Murayama, M. / Murayama, K. / Terada, T. / Shirouzu, M. / Yokoyama, S. / RIKEN Structural Genomics/Proteomics Initiative (RSGI) |
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引用 | ジャーナル: To be Published タイトル: Crystal structure of nucleoside diphosphate kinase in complex with GTP analog 著者: Kato-Murayama, M. / Murayama, K. / Terada, T. / Shirouzu, M. / Yokoyama, S. |
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履歴 | 登録 | 2006年8月25日 | 登録サイト: PDBJ / 処理サイト: PDBJ |
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改定 1.0 | 2007年2月25日 | Provider: repository / タイプ: Initial release |
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改定 1.1 | 2008年4月30日 | Group: Version format compliance |
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改定 1.2 | 2011年7月13日 | Group: Derived calculations / Source and taxonomy / Version format compliance |
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改定 1.3 | 2023年10月25日 | Group: Data collection / Database references ...Data collection / Database references / Derived calculations / Refinement description カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model / struct_site Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ..._database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _struct_site.pdbx_auth_asym_id / _struct_site.pdbx_auth_comp_id / _struct_site.pdbx_auth_seq_id |
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