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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 2cs7 | ||||||
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タイトル | 1.2 A Crystal structure of the S. pneumoniae PhtA histidine triad domain a novel zinc binding fold | ||||||
![]() | pneumococcal histidine triad A protein | ||||||
![]() | STRUCTURAL GENOMICS / UNKNOWN FUNCTION / PhtA / Pneumococcal Histidine Triad Protein / S.pneumoniae | ||||||
機能・相同性 | ![]() | ||||||
生物種 | ![]() ![]() | ||||||
手法 | ![]() ![]() ![]() | ||||||
![]() | Riboldi-Tunnicliffe, A. / Isaacs, N.W. / Mitchell, T.J. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: 1.2 Angstroms crystal structure of the S. pneumoniae PhtA histidine triad domain a novel zinc binding fold. 著者: Riboldi-Tunnicliffe, A. / Isaacs, N.W. / Mitchell, T.J. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 82.8 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 63.3 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 431.1 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 432.5 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 10.3 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 15.2 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 | ![]()
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2 | ![]()
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3 | ![]()
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単位格子 |
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Components on special symmetry positions |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 6025.408 Da / 分子数: 3 断片: Pneumococcal Histidine Triad Protein Domain (residues 166-220) 由来タイプ: 組換発現 由来: (組換発現) ![]() ![]() 遺伝子: PhtA (18-220) / プラスミド: pQE10 / 発現宿主: ![]() ![]() #2: 化合物 | #3: 水 | ChemComp-HOH / | |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 1.8 Å3/Da / 溶媒含有率: 33 % |
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結晶化 | 温度: 290 K / 手法: 蒸気拡散法, シッティングドロップ法 / pH: 7 詳細: 1.6M Ammonium Sulphate, 100mM Hepes, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 290K |
-データ収集
回折 | 平均測定温度: 100 K |
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放射光源 | 由来: ![]() ![]() ![]() |
検出器 | タイプ: MARRESEARCH / 検出器: CCD / 日付: 2003年8月28日 / 詳細: Mirrors |
放射 | プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray |
放射波長 | 波長: 1 Å / 相対比: 1 |
反射 | 解像度: 1.2→72.5 Å / Num. obs: 49793 / % possible obs: 93.9 % / Observed criterion σ(F): 2 / Observed criterion σ(I): 2 |
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解析
ソフトウェア |
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精密化 | 構造決定の手法: ![]()
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溶媒の処理 | イオンプローブ半径: 0.8 Å / 減衰半径: 0.8 Å / VDWプローブ半径: 1.2 Å / 溶媒モデル: BABINET MODEL WITH MASK | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
原子変位パラメータ | Biso mean: 8.828 Å2
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精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 1.2→72.55 Å
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拘束条件 |
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LS精密化 シェル | 解像度: 1.2→1.235 Å / Total num. of bins used: 20 /
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精密化 TLS | 手法: refined / Origin x: 22.111 Å / Origin y: 9.181 Å / Origin z: 19.185 Å
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精密化 TLSグループ |
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